Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  286  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82736698--82736917
46
5.0
46
84
9
278
21
24
15
39
1.92
82736830--82736905
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2.0
38
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0
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21
26
18
34
1.96
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4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
82741947--82742166
46
5.0
46
84
9
278
21
24
15
39
1.92
82742079--82742154
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
82744249--82744300
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
82749701--82749732
17
1.9
16
93
6
55
87
0
12
0
0.54
82750680--82750846
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2.3
73
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253
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17
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1.96
82750826--82750870
13
3.4
13
81
6
63
15
11
4
68
1.34
82750757--82751042
100
2.9
101
86
1
389
24
17
18
39
1.92
82750764--82751134
100
3.8
99
80
8
374
26
16
18
38
1.92
82751053--82751430
75
5.0
74
84
7
435
29
17
20
32
1.95
82751053--82751390
76
4.5
74
86
4
466
31
16
21
31
1.95
82751529--82751882
72
4.8
72
83
7
446
31
16
19
33
1.94
82751526--82752037
145
3.4
146
86
7
616
30
15
19
33
1.93
82751908--82752192
78
3.6
76
76
15
272
29
18
19
32
1.96
82752060--82752093
14
2.4
14
90
0
50
23
20
2
52
1.60
82751766--82752192
167
2.6
161
82
6
484
29
18
19
32
1.95
82752003--82752170
89
1.9
89
87
2
246
28
19
20
32
1.96
82752877--82752962
30
2.9
30
92
0
145
26
48
5
18
1.70
82753443--82753503
19
3.3
19
78
15
65
39
3
0
57
1.15
82753456--82753626
25
6.7
25
66
23
88
37
4
2
54
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82753456--82753626
55
3.1
52
75
17
136
37
4
2
54
1.36
82753544--82753620
27
2.7
29
75
15
81
35
5
3
55
1.40
82753581--82753662
25
3.4
23
77
12
76
31
6
6
56
1.49
82753816--82753850
16
2.3
15
90
5
52
31
2
2
62
1.24
82757291--82758160
187
4.6
188
97
0
1638
29
16
19
34
1.94
82757278--82758160
375
2.4
375
96
0
1646
30
16
18
34
1.94
82759469--82759512
22
2.0
22
95
0
79
29
9
29
31
1.88
82761655--82761713
21
2.8
22
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7
70
23
0
6
69
1.12
82761684--82761743
26
2.4
24
83
8
75
28
0
3
68
1.05
82761896--82761938
16
2.7
16
92
0
77
13
55
30
0
1.39
82767366--82767415
26
1.9
26
100
0
100
44
24
20
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1.85
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18
2.4
18
80
3
52
52
13
11
22
1.72
82787251--82787302
20
2.7
19
85
5
77
7
30
0
61
1.24
82792221--82792368
43
3.5
42
82
8
165
26
18
25
29
1.98
82793987--82794515
47
11.3
47
91
0
844
28
28
8
34
1.86
82794296--82794371
22
3.3
22
66
16
64
26
30
10
32
1.90
82803069--82803157
44
2.0
44
100
0
178
34
29
6
29
1.83
82805653--82805677
13
1.9
13
100
0
50
88
0
0
12
0.53
82810736--82810771
2
18.5
2
88
5
56
50
2
0
47
1.15
82814610--82814849
44
5.5
42
76
5
185
18
25
22
33
1.96
82814640--82814849
43
4.8
44
73
11
182
18
24
22
34
1.96
82835686--82835755
33
2.2
30
82
9
86
52
2
5
38
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82835970--82836204
3
76.0
3
76
13
160
60
5
2
31
1.33
82836786--82836816
12
2.6
12
100
0
62
12
0
6
80
0.89
82837183--82837261
35
2.3
34
91
2
122
20
8
49
21
1.76
82841292--82841400
26
4.2
26
94
1
175
33
5
23
36
1.78
82845771--82845825
23
2.4
23
87
6
76
12
1
36
49
1.52
82846862--82846901
21
2.0
20
95
5
71
67
0
2
30
1.04
82848552--82848704
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1.9
82
84
4
209
26
28
11
33
1.91
82848942--82849028
35
2.5
37
76
14
94
45
11
2
40
1.53
82851923--82851975
23
2.3
23
96
0
97
28
5
13
52
1.62
82855898--82855930
16
2.0
17
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15
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39
1.69
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3
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14
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34
4
0
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1.18
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12
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5
0
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21
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21
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20
21
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130
2.4
130
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36
20
20
22
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82873362--82873442
3
27.0
3
70
14
51
34
4
0
60
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
0
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20
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1.70
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2
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
21
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1.30
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20
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1.96
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133
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220
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133
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20
16
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0
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0.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0.84
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1.98
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1.98
82963466--82963650
101
1.8
99
87
2
271
29
27
18
25
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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