Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  107  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26547504--26547545
22
2.0
20
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9
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4
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33
1.72
26548316--26548383
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5
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44
4
19
32
1.70
26562095--26562225
49
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44
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11
147
26
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29
22
1.99
26565893--26565934
5
8.2
5
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5
57
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0
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19
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3.2
16
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10
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1
3
21
1.10
26576683--26576784
29
3.5
29
86
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143
27
15
32
24
1.96
26584615--26584716
29
3.5
29
86
5
143
27
15
32
24
1.96
26586502--26586820
47
6.7
47
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19
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1.98
26586685--26586818
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2.7
49
80
10
137
28
20
27
23
1.99
26586549--26586813
139
1.9
140
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397
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0
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0
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50
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18
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54
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5
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11
1.00
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30
2.6
30
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0
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31
1.85
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47
5.7
48
80
7
230
23
30
18
28
1.97
26622008--26622227
46
4.7
47
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14
147
23
30
18
28
1.97
26621961--26622227
140
1.9
141
83
5
353
23
30
17
28
1.97
26628087--26628124
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63
26640023--26640287
47
5.7
47
78
9
240
23
31
20
25
1.98
26640023--26640287
140
1.9
141
84
3
356
23
31
20
25
1.98
26643632--26643848
42
5.2
41
81
5
229
28
29
26
15
1.96
26643632--26643849
84
2.6
84
83
0
276
27
30
26
15
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26644569--26644836
47
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45
78
9
225
23
30
16
29
1.97
26651595--26651648
26
2.1
26
100
0
108
24
33
7
35
1.83
26651599--26651654
26
2.2
26
93
0
94
25
37
7
30
1.82
26661412--26661635
40
5.6
40
92
1
360
32
28
20
17
1.96
26661412--26661635
79
2.8
79
93
1
358
32
28
20
17
1.96
26670512--26670596
41
2.1
41
100
0
170
23
15
11
49
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26673364--26673410
23
2.0
23
100
0
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31
21
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38
1.83
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25
2.0
26
84
4
66
42
8
0
50
1.32
26686053--26686144
45
2.0
45
97
0
175
42
2
31
23
1.66
26697598--26697641
20
2.1
22
83
8
56
31
4
0
63
1.14
26704138--26704189
27
2.0
25
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7
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55
0
0
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27
1.03
26719302--26719371
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2.1
34
100
0
140
47
25
8
18
1.77
26719668--26719839
93
1.8
93
94
0
308
27
30
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20
1.98
26719660--26719835
46
3.8
46
81
10
214
28
29
21
21
1.98
26725013--26725057
20
2.2
20
80
7
56
24
8
2
64
1.34
26740394--26740456
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5.2
12
78
17
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22
3
0
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0.96
26740401--26740456
25
2.3
24
93
3
94
23
3
0
73
0.99
26742439--26742463
10
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10
100
0
50
28
12
0
60
1.32
26742504--26742599
40
2.4
41
82
3
115
34
26
16
22
1.95
26742682--26742796
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103
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13
2.0
13
100
0
52
23
0
23
53
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26743207--26743259
15
3.6
14
85
5
52
22
1
52
22
1.56
26743210--26743261
22
2.4
22
80
6
61
23
1
50
25
1.60
26743200--26743261
7
8.6
7
73
7
52
20
1
50
27
1.58
26743302--26743362
21
2.8
22
80
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63
18
0
37
44
1.50
26743919--26743954
18
1.9
18
94
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63
27
38
0
33
1.57
26746341--26746375
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2.2
16
89
0
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28
8
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1.84
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96
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1.82
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9
9
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3
0
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1.18
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11
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11
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25
1.97
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2.0
21
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1.40
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0
0
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0
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3
1.67
26804953--26805040
28
3.2
28
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3
142
35
27
6
30
1.83
26805156--26805234
27
2.8
27
86
5
104
22
25
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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10
3.3
10
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29
8
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52
1.62
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8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
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28
3.3
28
93
3
157
34
27
7
30
1.85
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26
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27
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10
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20
24
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31
1.98
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20
2.0
20
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42
10
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3
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1.11
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23
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1.98
26863840--26864142
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1.98
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54
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2
0
81
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.00
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28
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180
25
31
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26947307--26947354
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26
1.97
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1.98
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1.98
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2.7
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8
128
21
29
25
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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