Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56559386--56559475
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24
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0
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32
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56559386--56559492
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31
14
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26
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56567692--56567757
28
2.4
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1.35
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2
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2.0
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18
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120
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17
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23
0
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11
4.5
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11
52
65
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7
19
1.43
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2.3
24
93
0
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67
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17
1.37
56601987--56602031
12
3.8
12
82
11
56
68
6
4
20
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
54
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25
15
1.93
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3.2
30
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27
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27
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2.0
16
93
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27
4.2
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35
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1.95
56623835--56623946
54
2.1
54
84
3
145
35
21
25
17
1.95
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2.1
16
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33
6
1.50
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2.0
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6
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30
15
23
1.95
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26
2.7
27
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2
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26
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1.91
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54
16
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1.68
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2.8
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29
16
30
23
1.96
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28
2.4
29
85
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95
26
11
33
28
1.91
56644989--56645015
12
2.2
12
100
0
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25
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37
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1.93
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2
25
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0.97
56647775--56647853
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20
2
72
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50
5.8
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275
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25
18
26
1.98
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101
2.4
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256
29
25
18
26
1.98
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3.7
46
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206
29
25
19
25
1.99
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93
1.8
93
93
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299
29
26
19
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1.99
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2.1
29
90
0
93
30
0
28
41
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56654809--56654905
30
3.2
30
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0
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1
0.81
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0
18
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0.83
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1.01
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0
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0
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30
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27
27
16
27
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35
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29
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28
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3.4
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2.0
30
86
0
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30
25
6
38
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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43
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29
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0
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0
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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30
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
17
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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