Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13046449--13046530
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29
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1.19
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19
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19
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1.63
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3.5
30
80
14
139
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15
0
36
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
37
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2.0
157
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0
526
46
14
3
35
1.62
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4.3
9
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2.0
942
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0
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26
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1.74
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2.0
63
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26
24
27
21
1.99
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26
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26
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0
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5
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28
1.35
13099938--13100001
20
3.2
20
84
6
69
64
4
3
28
1.29
13099957--13100019
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2
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1.46
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67
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0
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1.01
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1.98
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3.7
87
81
7
331
27
23
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13111562--13111819
133
2.0
133
83
3
333
27
22
17
31
1.97
13111830--13112050
89
2.5
90
79
5
232
26
25
19
29
1.98
13116558--13116604
22
2.1
23
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71
46
10
19
23
1.80
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56
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2.0
20
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0
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2
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7
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0
0
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0.78
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38
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5
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23
16
25
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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1.71
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9
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9
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1
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1
0
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15
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2
60
1.37
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12
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1
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1.19
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0
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10
223
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2
6
27
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13271922--13272030
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0
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0.91
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1.91
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130
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5
370
39
15
23
21
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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