Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13599678--13599716
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2
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0
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0
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28
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20
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3.0
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28
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3.0
30
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101
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17
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1.62
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0
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3.0
30
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9
79
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15
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1.8
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29
21
20
1.98
13622217--13622392
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
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2.1
26
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0
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0
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1.93
13631235--13631271
7
5.4
7
90
6
58
27
13
35
24
1.93
13632310--13632339
12
2.5
12
94
0
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1.60
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4.2
26
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1.83
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379
36
13
12
37
1.83
13642898--13642944
18
2.5
19
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2
36
1.21
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22
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3
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90
0
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50
0
2
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14
75
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1
4
29
1.20
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3.7
18
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11
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1
5
31
1.29
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30
2.9
30
94
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17
1.71
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3.3
18
68
29
55
24
7
50
16
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13650732--13651461
43
16.9
43
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22
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4.5
173
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1057
20
23
22
34
1.97
13651206--13651451
44
5.7
43
70
15
157
19
23
23
34
1.97
13650682--13651464
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9.1
86
85
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20
23
22
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1.97
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2.3
19
100
0
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36
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11
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17
53
50
13
17
19
1.78
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19
2.4
19
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58
50
13
17
19
1.78
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1
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30
1.19
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18
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11
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1
3
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1.19
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52
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10
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27
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82
27
13
22
36
1.91
13678196--13678331
26
5.2
26
93
0
236
36
24
5
33
1.78
13678196--13678331
52
2.6
52
98
0
263
36
24
5
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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31
16
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22
1.96
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67
2.8
64
78
8
203
28
16
30
23
1.96
13686141--13686230
33
2.7
31
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13
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21
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3
25
1.64
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33
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33
77
8
206
23
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3
31
1.72
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4.1
66
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1
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23
42
4
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1.73
13686227--13686530
99
3.1
99
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229
23
41
3
31
1.72
13686236--13686491
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1.9
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24
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1.73
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0
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26
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0
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1.9
17
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39
3
3
54
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13748091--13748210
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54
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27
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0
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22
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54
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2.0
25
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0
91
36
6
4
54
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13807668--13807719
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0
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0
0
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0
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0
0
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55
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0
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17
20
38
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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