Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  86  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20423247--20423296
24
2.0
25
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3
75
64
0
2
34
1.05
20423341--20423538
3
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3
67
25
87
61
1
2
34
1.19
20423342--20423529
19
9.7
19
72
22
94
61
1
2
34
1.20
20423319--20423563
11
21.7
11
68
20
109
61
1
2
34
1.19
20423320--20423459
18
7.2
18
72
22
90
61
2
1
35
1.17
20423319--20423559
41
6.0
40
71
21
139
60
1
2
34
1.19
20423362--20423529
47
3.5
47
76
17
134
61
1
2
34
1.19
20423362--20423482
25
4.9
26
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1
1
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1.15
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23
1.9
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90
4
74
22
24
11
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54
4.8
52
80
7
248
20
25
17
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1.95
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107
1.9
109
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316
22
26
18
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23
1.9
24
90
4
74
22
24
11
42
1.86
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55
4.8
53
80
7
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21
25
16
36
1.94
20435984--20436184
108
1.8
110
87
4
300
21
25
17
34
1.95
20438173--20438272
27
3.7
27
72
2
78
36
17
17
30
1.92
20447194--20447301
26
4.2
26
90
0
171
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7
24
36
1.83
20448921--20449028
27
4.0
27
81
9
121
17
23
22
37
1.94
20448919--20449030
54
2.1
54
86
3
154
16
23
22
37
1.94
20454303--20454403
26
3.9
26
93
2
168
32
6
23
36
1.82
20455971--20456085
27
4.3
26
84
7
140
16
22
23
37
1.94
20455971--20456085
54
2.1
54
87
3
160
16
22
23
37
1.94
20457766--20457817
26
2.0
27
84
3
70
26
13
25
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20457778--20457900
26
4.8
25
69
14
72
22
14
30
31
1.94
20461424--20461490
2
33.5
2
96
0
125
50
47
0
1
1.10
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2
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2
100
0
86
48
0
0
51
1.00
20465692--20465724
10
2.9
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82
17
52
30
0
0
69
0.88
20469389--20469422
17
2.1
16
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50
55
0
2
41
1.15
20469696--20469726
6
5.0
6
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0
0
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5
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57
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0
0
18
0.70
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9
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0
0
19
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20486891--20486926
18
2.0
18
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0
54
33
0
25
41
1.55
20489533--20489590
21
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22
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12
24
31
1.91
20492843--20492957
44
2.6
44
90
0
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25
27
13
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1.94
20493206--20493387
94
1.9
94
89
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285
28
21
19
31
1.97
20503684--20503713
15
2.0
15
93
0
51
20
23
13
43
1.86
20505502--20505551
26
1.9
26
84
8
66
62
0
6
32
1.20
20505556--20505594
15
2.6
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11
51
53
0
12
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1.39
20505608--20505708
33
3.2
31
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10
89
58
2
1
36
1.25
20514540--20514602
21
3.0
21
84
9
76
31
12
23
31
1.92
20517379--20517452
26
2.8
26
78
12
71
59
2
4
33
1.30
20517407--20517502
12
7.6
12
75
14
77
58
0
5
36
1.21
20517408--20517499
7
13.9
7
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18
63
56
0
5
38
1.22
20519247--20519829
44
13.2
44
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2
758
26
28
14
30
1.95
20532022--20532104
12
6.6
12
75
14
69
57
0
6
36
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20532023--20532101
7
11.9
7
72
18
62
55
0
6
37
1.25
20531999--20532083
26
3.3
25
79
10
91
57
1
4
36
1.27
20532039--20532102
18
3.7
17
75
18
53
56
0
6
37
1.25
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0
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0
0
75
0.80
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2.0
15
100
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26
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1.64
20536319--20536364
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7.7
6
82
0
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78
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6
13
1.04
20538171--20538221
20
2.5
20
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20
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1.22
20543135--20543165
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2.4
13
100
0
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12
22
19
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1.84
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20
4.3
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88
2
131
34
12
20
32
1.90
20552242--20552317
11
7.5
11
74
16
83
34
13
21
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1.91
20552367--20552436
26
2.7
26
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27
27
22
22
1.99
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1.9
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35
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23
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1.95
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18
2.0
19
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2
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28
1.30
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1.82
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27
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0
0
50
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26
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0
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4
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20580695--20580778
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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26
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20604518--20604569
21
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0
104
0
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22
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10
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20.5
2
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0
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
36
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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