Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  314  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90539105--90539133
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2
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0
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0
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0
0
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0.90
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2.9
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51
5
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1.65
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2.2
236
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17
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1.9
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19
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67
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72
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12
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2
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135
2.1
136
96
1
527
24
18
25
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
26
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0
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5
23
35
1.80
90566809--90567092
135
2.1
137
96
2
520
24
18
25
32
1.97
90570019--90570192
37
4.7
37
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1
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22
18
1.84
90570169--90570253
37
2.3
37
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10
11
23
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90583073--90583133
21
2.9
21
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9
61
14
22
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1.86
90583073--90583183
42
2.6
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134
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2.5
40
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15
11
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2.0
20
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10
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13
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3.1
15
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10
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50
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24
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45
1.36
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14
2.4
14
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32
2
2
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1.26
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19
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78
19
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56
52
5
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1.39
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2.8
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1.08
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22
3.0
22
72
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53
1
0
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90618555--90618610
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0
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2.7
23
79
15
70
62
8
3
25
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90620596--90620672
38
2.0
39
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120
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1.46
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33
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0
0
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1.91
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20
1.11
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23
17
24
1.96
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17
29
1.93
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2.6
14
90
0
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52
2
19
25
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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67
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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