Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  371  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107748888--107750017
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207
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107750417--107750533
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3.3
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189
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10
15
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1.81
107752789--107752868
29
2.6
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107752789--107752877
29
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31
10
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100
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2.1
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27
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1.37
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2.0
24
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53
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1.39
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2.1
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50
5
0
44
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3.4
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1
0
47
1.12
107783407--107783441
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2.2
16
90
5
54
51
2
0
45
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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2.0
13
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15
23
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15
24
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25
2.1
25
100
0
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40
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20
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2.1
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3.4
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23
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1.80
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2.2
29
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80
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10
43
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29
2.0
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1.74
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82
0
201
17
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1.91
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2.1
137
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24
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24
23
21
1.99
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23
2.1
23
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24
38
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28
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1.97
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2.6
25
83
11
80
23
20
24
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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22
25
1.97
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3.1
14
100
0
88
27
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13
50
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29
1.9
30
92
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98
29
7
14
49
1.69
107901961--107902024
29
2.2
29
86
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85
31
9
12
46
1.73
107909630--107909915
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2.1
137
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18
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1.97
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7
134
37
22
23
16
1.94
107963641--107963752
54
2.1
54
86
3
154
37
22
23
16
1.94
107965160--107965213
25
2.2
25
93
0
90
18
35
5
40
1.74
107965170--107965223
25
2.2
25
90
3
83
16
42
1
38
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107971494--107971597
27
3.8
27
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9
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36
19
24
20
1.95
107971489--107971600
54
2.1
54
86
3
154
36
18
24
20
1.95
107974846--107974877
12
2.7
12
100
0
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6
21
1.74
107975988--107976013
9
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9
100
0
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0
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1.25
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2.5
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3
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33
25
17
23
1.96
107979249--107979274
9
2.9
9
100
0
52
65
23
0
11
1.25
107982243--107982330
34
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34
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7
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29
26
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21
1.99
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6
100
0
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19
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15
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36
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22
22
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1.99
107991588--107991700
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1.99
107991610--107991724
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7
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22
24
1.98
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15
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3
0
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1.17
107995245--107995330
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2.7
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0
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18
22
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18
1.91
107998454--107998531
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3.9
20
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2
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1.16
107999959--108000014
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2.3
24
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66
1
1
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1.12
107999959--108000010
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6.5
8
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8
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65
1
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30
1.14
108000166--108000230
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1.55
108000245--108000318
2
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55
1
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108000348--108000393
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.5
30
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1
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21
3
48
25
1.66
108001706--108002123
88
4.9
85
70
15
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37
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15
27
1.92
108001877--108001938
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2.1
30
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9
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1.83
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280
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18
29
1.95
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33
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17
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1.95
108002202--108002375
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2
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20
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1.97
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74
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1.95
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1.94
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0
0
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0
0
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1.48
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0
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26
1.97
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1.9
19
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1.96
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50
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0
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1.99
108026066--108026133
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2.2
31
91
0
109
25
22
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108026155--108026373
47
4.7
47
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28
13
26
31
1.94
108026245--108026408
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3.7
43
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9
190
29
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27
28
1.95
108026155--108026373
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2.4
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259
28
13
26
31
1.94
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1.89
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0
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2.0
54
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10
134
37
18
16
28
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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