Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5377364--5377419
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3.4
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1.91
5377380--5377442
18
3.5
18
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0
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2.1
21
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0
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0
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13
1
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1.20
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3.5
12
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14
0
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2.2
24
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1
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0
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19
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12
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29
24
0
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
23
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15
3.1
15
81
0
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36
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25
2.0
25
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59
1
19
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70
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31
2.0
32
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1
45
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25
2.0
25
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20
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1.92
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137
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24
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4
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25
2.0
25
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64
38
20
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24
1.92
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135
2.1
137
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529
24
18
25
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1.98
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2.1
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0
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2.0
13
100
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0
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2
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1.19
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25
2.0
25
84
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20
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24
1.92
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15.7
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82
8
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36
0
2
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5
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53.2
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21
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31
2
5
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14
6.6
14
74
16
54
28
2
3
66
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5430857--5431241
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2
5
60
1.33
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2.6
44
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2
149
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13
22
27
1.92
5437512--5437645
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
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21
2.0
21
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2
35
1.70
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1
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17
20
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0
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2
3
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17
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3
4
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1.32
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178
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4
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30
3
4
62
1.28
5448772--5449063
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2.2
129
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31
2
5
60
1.33
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2.2
12
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0
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27
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2
156
19
25
21
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5476452--5476591
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2
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19
25
21
34
1.96
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43
3.6
43
78
10
140
38
21
23
16
1.93
5479064--5479298
88
2.7
87
85
3
303
37
20
22
20
1.94
5479366--5479527
88
1.8
88
84
2
218
37
21
19
20
1.94
5479145--5479658
222
2.3
222
90
2
816
36
22
20
20
1.95
5479586--5479699
43
2.6
45
78
8
126
36
25
18
19
1.94
5481556--5481601
2
24.0
2
82
8
60
45
2
2
50
1.26
5481545--5481601
11
5.4
11
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2
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1
1
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26
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1
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37
25
4
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1.76
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2.1
12
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0
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0
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0
0
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20
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2
2
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44
3
0
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1.18
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19
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1
1
39
1.15
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0
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1.09
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0
0
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21
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4
24
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1.76
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27
4.2
27
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138
15
24
23
36
1.94
5517297--5517411
54
2.1
54
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3
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15
24
23
36
1.94
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1
1
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1.15
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26
2.2
29
88
8
90
56
1
0
41
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
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0
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0
15
0
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20.3
3
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2.0
38
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0
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16
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0
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0
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0
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22
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136
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1.97
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2.0
20
86
4
57
40
0
0
59
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5573166--5573219
22
2.3
24
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1
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5.2
26
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0
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13
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0
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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