Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99311288--99311381
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1.98
99321947--99322192
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2
323
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21
27
26
2.00
99350111--99350292
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48
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197
28
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27
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20
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24
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21
25
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255
29
23
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25
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2.4
70
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2
286
29
23
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25
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2.1
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0
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99392733--99392846
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2.0
57
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0
219
21
27
24
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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28
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1.95
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0
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2.4
26
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17
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35
1.88
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2.1
26
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1.90
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29
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0
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20
21
28
1.98
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1
3
30
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2
11
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132
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1043
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19
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25
22
19
32
1.97
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2.9
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276
27
21
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28
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6.5
130
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20
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22
21
35
1.96
99441759--99442644
256
3.4
252
86
6
1101
19
22
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99442754--99442880
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0
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2.2
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0
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53
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0
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14
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81
0
0
17
82
0.66
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1.20
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2.6
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1
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3
123
40
21
10
27
1.87
99477999--99478211
23
9.1
23
91
3
336
27
21
23
28
1.99
99477999--99478211
70
3.0
70
97
0
390
27
21
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99477997--99478212
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4.6
47
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2
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21
22
28
1.99
99478270--99478326
9
5.9
9
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15
51
35
21
8
35
1.84
99478265--99478328
20
3.2
20
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0
119
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18
12
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1.89
99478265--99478317
11
5.2
11
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32
18
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1.90
99481764--99481936
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3.8
45
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10
190
28
30
20
21
1.98
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1.8
92
92
2
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27
30
20
21
1.98
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15
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93
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1.98
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29
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1.98
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40
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28
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22
1.99
99498147--99498327
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28
28
20
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1.99
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2.7
29
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1.95
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2
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1.30
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27
2.6
27
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0
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24
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1.98
99511697--99511783
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1.97
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2
0
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2
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1
0
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3.3
15
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20
50
30
0
0
69
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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22
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1.95
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2.0
39
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0
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2.0
100
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1.96
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1.96
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222
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1.95
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183
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22
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1.96
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0
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18
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26
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1
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30
25
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99585567--99585742
52
3.4
52
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28
1.96
99585576--99585742
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2.1
78
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0
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25
14
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1.95
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0
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0
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0
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1.00
99610781--99610846
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2.0
34
82
5
82
72
4
0
22
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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