Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  288  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83202743--83202792
14
3.6
14
94
0
91
48
12
14
26
1.78
83209515--83209584
27
2.6
27
82
6
81
50
2
17
30
1.60
83209568--83209664
26
3.6
27
77
5
99
56
1
8
34
1.36
83211683--83211825
72
2.0
72
86
2
198
30
7
13
48
1.71
83216154--83216247
48
1.9
49
87
6
138
53
2
14
29
1.53
83216895--83216958
31
2.1
31
82
5
76
54
9
12
23
1.66
83219060--83219160
17
5.9
17
72
4
60
43
15
10
29
1.81
83226987--83227092
23
4.7
22
71
21
71
61
0
38
0
0.96
83227057--83227106
17
3.0
17
80
13
59
60
0
40
0
0.97
83233198--83233243
2
23.0
2
95
0
83
50
2
0
47
1.13
83234321--83234378
29
2.0
30
83
10
75
1
32
6
58
1.35
83238657--83238705
21
2.4
21
90
10
75
51
4
4
40
1.40
83239587--83239772
9
19.9
9
65
22
64
36
1
3
58
1.23
83239588--83239669
23
3.6
23
70
15
71
37
1
2
58
1.19
83239590--83239772
20
8.7
20
69
21
92
36
1
3
59
1.23
83247493--83247556
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
83247748--83247890
24
6.0
24
90
7
202
25
23
22
28
1.99
83247748--83247889
47
3.0
48
89
7
200
26
23
22
28
1.99
83247747--83247890
71
2.0
72
88
6
213
25
22
22
29
1.99
83247941--83248000
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
83248043--83248090
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
83250007--83250046
20
1.9
22
85
10
57
42
10
0
47
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83251293--83251325
16
2.0
17
88
5
50
24
9
0
66
1.20
83253982--83254021
17
2.4
16
84
8
53
65
10
2
22
1.35
83256278--83256357
37
2.2
37
97
0
151
33
10
7
48
1.65
83259192--83259227
2
18.0
2
94
0
63
47
2
0
50
1.15
83260445--83260483
2
19.5
2
83
0
51
2
56
0
41
1.13
83267577--83267621
22
2.0
22
91
0
72
48
15
2
33
1.57
83272174--83272218
22
2.0
22
91
0
72
48
15
2
33
1.57
83273877--83273945
27
2.6
27
100
0
138
7
5
23
63
1.42
83274090--83274173
41
2.0
41
90
4
134
30
8
9
51
1.64
83274565--83274604
20
2.0
21
90
5
64
15
2
12
70
1.28
83282224--83282303
40
2.0
40
97
0
151
41
15
16
27
1.88
83288850--83288923
31
2.4
31
81
0
85
37
39
4
18
1.70
83289541--83289845
152
2.0
152
96
1
567
32
22
15
29
1.95
83291501--83291546
20
2.3
20
85
7
58
36
19
4
39
1.72
83292231--83292291
32
1.9
32
93
0
104
22
34
19
22
1.97
83295416--83295462
24
2.0
24
100
0
94
27
4
21
46
1.69
83298823--83298949
44
2.8
46
84
4
159
29
23
13
33
1.93
83303548--83303607
19
3.0
20
85
7
77
46
0
11
41
1.40
83304962--83305001
18
2.2
18
86
8
55
20
0
12
67
1.22
83305215--83305299
43
2.0
42
86
2
116
51
2
23
22
1.59
83307079--83307110
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
83307699--83307759
31
2.0
31
83
3
79
39
4
4
50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83311355--83311391
3
12.3
3
100
0
74
35
0
0
64
0.94
83312894--83312952
2
30.0
2
91
3
93
52
0
1
45
1.10
83318218--83318264
24
2.0
24
86
0
67
21
25
4
48
1.68
83318308--83318334
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
83324059--83324100
13
2.9
15
79
17
52
64
2
0
33
1.07
83325623--83325668
21
2.0
24
84
12
62
6
21
10
60
1.52
83325932--83325976
21
2.1
21
83
0
54
22
0
20
57
1.40
83335445--83335478
17
2.0
17
94
0
59
29
17
8
44
1.79
83337782--83337812
7
4.4
7
100
0
62
38
12
32
16
1.86
83338798--83338870
17
4.5
17
72
16
57
54
2
2
39
1.29
83339252--83339319
29
2.3
29
82
0
91
35
10
25
29
1.89
83345816--83345850
17
2.1
17
100
0
70
45
17
17
20
1.85
83355420--83355894
27
17.6
27
86
4
600
27
21
9
41
1.84
83355887--83355958
27
2.7
27
77
0
81
40
22
8
29
1.83
83357135--83357182
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
83357226--83357284
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
83357230--83357284
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
83357332--83357477
24
6.1
24
91
4
215
28
22
21
26
1.99
83357332--83357477
47
3.0
47
91
5
213
28
22
21
26
1.99
83357335--83357478
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
83360188--83360226
4
10.0
4
94
5
71
51
0
0
48
1.00
83362722--83362839
62
1.9
59
85
8
157
40
4
4
50
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83365537--83365653
39
3.0
39
83
1
135
41
27
17
12
1.86
83366287--83366318
14
2.3
14
94
0
55
62
12
3
21
1.43
83367097--83367121
12
2.1
12
100
0
50
20
16
8
56
1.65
83378615--83378803
41
4.7
41
86
2
240
20
22
27
29
1.98
83378615--83378841
81
2.8
80
81
4
206
20
22
29
28
1.98
83383265--83383329
25
2.9
23
80
15
66
66
7
0
26
1.19
83383291--83383329
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
83390744--83390855
55
2.0
55
91
3
181
33
17
12
35
1.88
83393082--83393219
42
3.1
42
69
6
105
30
25
16
27
1.97
83396292--83396350
31
1.9
31
86
10
86
49
3
20
27
1.65
83396315--83396358
24
1.9
22
86
9
61
45
2
22
29
1.65
83404190--83404355
43
3.9
43
94
0
271
24
14
27
34
1.94
83404190--83404401
85
2.5
86
86
4
270
25
14
25
33
1.94
83415631--83415755
49
2.5
49
85
6
164
21
28
22
27
1.99
83415820--83415989
46
3.7
46
75
9
148
21
25
21
31
1.98
83415776--83415989
94
2.3
94
81
3
243
22
26
21
29
1.99
83415863--83415987
48
2.7
46
82
7
146
21
24
21
32
1.98
83424820--83425034
46
4.6
47
77
4
193
23
25
20
31
1.98
83424726--83424994
94
2.9
94
80
4
258
24
26
19
29
1.98
83424716--83425043
94
3.5
94
76
5
252
24
26
20
28
1.99
83427217--83427251
14
2.6
14
90
4
54
28
2
14
54
1.54
83429505--83429587
40
2.1
40
90
4
132
27
25
9
37
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83430855--83430896
20
2.1
20
90
0
66
64
2
23
9
1.35
83433312--83433341
5
5.8
5
96
4
51
16
0
0
83
0.65
83436014--83436363
39
9.0
39
91
0
540
22
26
29
22
1.99
83438230--83438276
23
2.0
23
100
0
94
40
4
21
34
1.73
83441596--83441625
5
5.8
5
96
4
51
16
0
0
83
0.65
83448418--83448467
10
5.0
10
81
13
59
68
2
8
22
1.26
83450264--83450457
54
3.6
53
80
8
223
36
17
25
21
1.95
83450271--83450470
107
1.9
109
87
4
298
35
17
25
22
1.95
83454767--83454829
14
4.6
14
77
16
53
71
0
6
22
1.08
83462534--83462560
14
1.9
14
100
0
54
44
14
11
29
1.80
83466575--83466623
20
2.5
19
80
9
53
32
4
12
51
1.58
83473162--83473196
17
2.0
17
88
5
52
25
5
0
68
1.11
83474897--83475070
26
6.8
26
84
2
208
31
3
3
62
1.29
83484501--83484553
26
2.0
27
85
10
74
35
5
0
58
1.22
83488919--83488947
13
2.2
13
100
0
58
24
0
13
62
1.32
83489990--83490167
40
4.4
40
81
6
189
26
14
25
33
1.95
83493479--83493522
20
2.4
17
88
11
61
65
0
34
0
0.93
83494357--83494388
6
5.3
6
92
0
55
21
18
12
46
1.82
83494357--83494394
18
2.1
18
90
0
58
21
23
10
44
1.83
83497065--83497132
20
3.4
20
76
8
75
11
26
16
45
1.81
83499104--83499135
16
2.0
16
100
0
64
56
18
6
18
1.62
83502720--83502854
24
5.6
24
97
0
234
20
17
25
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83502720--83502876
48
3.3
48
91
1
235
22
17
24
35
1.95
83502720--83502876
72
2.2
72
88
2
226
22
17
24
35
1.95
83504341--83504610
47
5.8
48
76
10
170
22
28
19
29
1.98
83504437--83504607
94
1.8
92
85
7
238
22
27
20
29
1.98
83504339--83504604
140
1.9
141
85
5
369
22
28
19
29
1.98
83515498--83515809
44
6.8
44
69
12
187
32
19
18
28
1.96
83517297--83517326
4
7.2
4
92
7
51
23
3
0
73
0.98
83517484--83517587
3
34.7
3
96
0
163
31
3
0
63
1.19
83521058--83521102
23
2.0
23
86
0
63
11
20
26
42
1.85
83524995--83525040
20
2.3
21
82
14
62
26
17
28
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444