Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  384  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111249277--111249479
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5.5
37
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3
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37
3.7
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1.69
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37
4.6
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131
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1.70
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2.1
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0
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20
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39
1.78
111264313--111264399
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22
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5
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185
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17
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1.80
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16
1.9
17
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6
57
34
6
12
46
1.67
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2.4
20
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62
50
8
10
31
1.66
111304006--111304058
20
2.6
20
84
3
70
47
7
16
28
1.74
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32
2.0
32
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38
10
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43
1.68
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42
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10
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111310105--111310158
28
1.9
28
92
0
90
25
5
11
57
1.55
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2.6
41
88
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153
23
16
28
32
1.96
111321893--111321917
9
2.8
9
100
0
50
56
0
8
36
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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2
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111327150--111327309
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3.3
49
92
1
252
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30
8
31
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2.6
41
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10
110
23
24
24
27
2.00
111330848--111331117
40
6.8
40
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1
481
25
28
20
25
1.99
111330848--111331117
118
2.3
120
93
2
481
25
28
20
25
1.99
111333216--111333424
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4.3
49
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30
30
8
31
1.86
111345088--111345232
49
2.9
48
77
5
130
33
18
22
25
1.97
111349142--111349202
23
2.7
22
74
5
68
6
14
3
75
1.13
111349155--111349193
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2.1
103
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16
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3.1
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18
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1.98
111359180--111359213
15
2.3
15
94
0
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52
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7
69
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56
36
38
0
24
1.62
111363212--111363260
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3.3
15
78
16
57
38
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2.0
22
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39
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2
25
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111374186--111374264
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2.8
28
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29
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3.0
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10
120
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17
28
26
1.98
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41
2.3
43
83
7
117
29
20
29
20
1.98
111374436--111374584
40
3.6
41
76
5
149
27
19
29
23
1.98
111380130--111380163
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50
0
0
50
1.00
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1.99
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111411213--111411332
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145
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16
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1
1
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1.16
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1.9
18
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5
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17
2
0
79
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.12
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29
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2.3
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29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
100
10
17
35
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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12
82
0
62
62
12
6
18
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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