Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  364  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105912166--105912206
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16
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4
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14
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22
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2.0
21
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2.6
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0
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2.0
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137
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4.0
40
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4.0
40
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24
26
22
2.00
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2.3
80
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23
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22
2.00
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0
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19
1.88
105948883--105949016
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1.9
72
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0
187
35
30
11
23
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105948880--105949016
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48
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11
22
1.90
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2.1
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0
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13
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2.0
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0
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4.0
64
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3.0
24
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0
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0
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9
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12
1
38
1.51
105954117--105954358
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35
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12
240
47
12
1
38
1.52
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1
37
1.54
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2.9
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1
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1.51
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14
2.1
14
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34
0
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1.56
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2.5
43
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25
20
23
1.98
105960513--105960644
43
3.2
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7
128
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25
20
24
1.99
105964460--105964678
112
2.0
112
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1
368
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1.96
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105967334--105967375
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2.2
18
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12
57
30
4
0
64
1.14
105967483--105967551
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33
2
0
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2
0
64
1.08
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43
1.84
105971622--105971671
15
3.5
15
79
15
52
20
24
14
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105978337--105978625
137
2.1
137
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524
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19
24
1.98
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3.2
26
96
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150
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33
1.77
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204
2.7
204
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17
21
29
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2.2
19
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12
59
30
4
0
64
1.14
105985027--105985068
19
2.2
18
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57
30
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0
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1.14
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19
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16
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4
0
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1.19
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0
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1
65
1.15
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0
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2.0
178
92
2
585
45
21
10
22
1.81
106018117--106018226
26
4.2
25
91
4
157
35
4
23
36
1.76
106020152--106020251
27
3.7
27
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6
112
20
25
21
34
1.97
106025839--106025994
85
1.8
84
81
10
192
25
20
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106035630--106035715
28
3.1
28
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3
93
32
15
19
32
1.93
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8
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70
0
0
30
0.88
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0
0
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13
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0
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1.80
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30
2.0
30
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1.54
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2
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2
100
0
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0
0
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19
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22
19
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25
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15
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23
0
29
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1.52
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22
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106045728--106045793
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14
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82
19
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106045749--106045790
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7
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16
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1.56
106045714--106045795
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106046042--106046112
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1.92
106050609--106050655
19
2.5
19
76
10
51
21
2
4
72
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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371
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21
23
1.97
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19
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1.97
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2.6
175
92
0
732
27
19
19
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.0
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100
0
100
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1.96
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1.87
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0
0
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5.6
54
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507
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17
14
30
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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