Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  296  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85546063--85546968
228
4.0
221
94
4
1584
23
9
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149
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0
0
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26
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0
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102
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12
2.5
12
94
0
51
6
3
13
76
1.11
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128
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395
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15
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85576923--85577217
120
2.4
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364
37
20
15
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1.93
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17
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1.12
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18
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1.9
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15
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2.4
20
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44
0
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2.0
33
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0
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33
16
16
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
24
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1
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1.21
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22
3.9
23
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12
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61
6
0
31
1.22
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0
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0
0
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210
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18
15
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11
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0
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5
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22
2.0
22
95
0
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53
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27
1.60
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0
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0
7
7
0.77
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6
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20.7
3
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0
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24
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15
100
0
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31
28
6
34
1.82
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290
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0
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1.11
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2.8
40
83
11
144
26
26
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85638567--85638659
48
1.9
47
80
8
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2.0
161
98
0
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16
17
39
1.91
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1.9
272
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1
829
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17
19
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1.95
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479
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22
1.90
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2.2
19
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26
2
1.13
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0
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23
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26
17
25
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0
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21
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Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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0.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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27
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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