Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  309  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89186079--89186122
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18
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2
2
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0
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2.2
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0
213
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19
18
1.95
89200735--89200950
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62
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17
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60
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2
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89219862--89219897
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2.4
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1
0
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23
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2.4
88
80
1
221
28
23
20
27
1.99
89225707--89225955
132
1.9
132
85
3
349
29
23
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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44
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20
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227
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20
32
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2.2
183
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2
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26
19
21
32
1.97
89227668--89228149
183
2.6
182
83
3
515
26
19
21
31
1.97
89236490--89236561
22
3.4
21
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11
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1
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0
0
50
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2.2
24
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48
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2.3
16
95
0
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29
29
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1.86
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17
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60
27
27
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37
1.84
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26
2.1
27
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6
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24
14
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1.93
89262803--89262878
26
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82
27
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1.91
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97
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3.2
9
95
4
51
86
0
13
0
0.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89272953--89272982
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2.0
15
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0
11
50
1.38
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66
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0
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2.0
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1.21
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63
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0
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29
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4
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30
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27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.99
89324643--89324812
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21
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1.99
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1.99
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28
1.99
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1.95
89339147--89339336
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58
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1.99
89342175--89342342
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22
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1.99
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0
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28
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
23
8
40
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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