Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  72  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17070971--17071024
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2.5
21
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17070970--17071024
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200
32
21
27
18
1.97
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201
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17095984--17096094
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3.2
36
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18
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2
2
42
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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15
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30
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17
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60
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1.24
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19
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0
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33
1.22
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23
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17147439--17147550
54
2.1
54
84
3
145
16
23
23
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17148492--17148527
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17
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27
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114
14
22
23
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1.92
17154103--17154211
54
2.0
54
83
3
139
14
22
23
38
1.92
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6
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1.50
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9
25
1.62
17160211--17160285
33
2.2
34
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1.60
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5
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59
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0
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24
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205
3.5
205
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0
1229
28
22
19
29
1.98
17175859--17175966
44
2.4
44
89
3
162
25
27
15
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17175897--17176097
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2.3
87
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14
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26
25
17
30
1.97
17175897--17176220
44
7.4
44
74
10
252
27
25
17
29
1.97
17175910--17176221
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2.4
131
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1
491
26
25
17
30
1.97
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1
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1
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0
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10
0
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2
10
0
86
0.66
17177112--17177187
15
5.0
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12
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2
10
0
86
0.66
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22
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21
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19
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0
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1.91
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1.95
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1.89
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27
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17209163--17209276
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2.1
54
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17
23
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2.0
22
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2
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1.61
17212703--17212789
44
2.0
45
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2
122
14
28
5
50
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17213595--17213624
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0
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0
0
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7
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0
0
80
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0
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2.0
21
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17221766--17221810
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1.97
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0
0
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0
0
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2
111
19
19
28
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17272662--17272696
17
2.1
17
100
0
70
28
25
17
28
1.97
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2.0
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1.85
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2.1
23
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0
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22
1.94
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26
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23
16
1.94
17283563--17283675
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0
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1.51
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10.4
26
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9
262
39
21
8
31
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444