Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  119  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30537720--30537760
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11
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0
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22
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1.98
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3.0
50
79
2
178
35
18
20
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1.95
30540236--30540383
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120
31
20
22
25
1.98
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3.5
50
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0
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27
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3.1
20
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72
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0
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50
1.23
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19
3.0
22
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0
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49
1.23
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3.8
46
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12
189
21
19
28
30
1.98
30612860--30613031
93
1.8
93
93
0
299
21
20
29
29
1.98
30620921--30621085
39
4.2
40
82
3
183
24
26
21
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30620936--30621085
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1.9
78
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24
27
22
26
1.99
30621903--30621948
17
2.5
19
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22
53
34
23
17
23
1.96
30627412--30627562
40
3.8
39
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2
142
23
27
22
25
2.00
30627412--30627562
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
30635330--30635480
40
3.8
39
82
2
142
23
27
22
25
2.00
30635330--30635480
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
30638981--30639146
24
7.0
24
88
4
239
26
21
22
28
1.99
30638980--30639146
47
3.5
48
89
4
241
26
21
22
29
1.99
30638981--30639147
71
2.3
71
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3
264
26
21
23
28
1.99
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5.9
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21
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35
1.84
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12
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2.0
24
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60
25
18
25
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1.98
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12.6
27
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40
9
22
28
1.84
30640586--30640925
187
1.8
187
88
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520
40
9
22
28
1.84
30642715--30642791
39
2.0
39
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0
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23
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123
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20
27
20
1.98
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92
2.2
93
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9
214
28
20
28
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1.99
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34
2.0
34
100
0
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29
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30
1.25
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20
2.4
20
86
10
62
61
6
4
27
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30668296--30668413
9
12.2
10
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81
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2
3
30
1.24
30668365--30668397
17
1.9
17
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0
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66
0
0
33
0.92
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30
2.4
29
82
8
83
62
2
2
31
1.24
30668612--30668693
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2.2
38
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2
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0
0
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1.57
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201
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20
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44
1
5
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10
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10
100
0
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23
2.4
24
81
9
69
76
1
1
20
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
1
20
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12
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10
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1
1
19
0.96
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2
2
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3
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0
2
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2.00
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24
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2.00
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1.00
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21
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0
0
57
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
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29
14
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31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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0
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22
7
28
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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