Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  382  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110873320--110873345
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2
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0
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0
0
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0
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1.00
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2.0
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100
0
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2.2
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3.5
205
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30
17
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30
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2.0
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5.2
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0.00
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20
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16
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28
6
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24
81
28
6
0
63
1.24
110895405--110895522
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2.7
43
78
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105
26
5
1
66
1.24
110895468--110895513
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2.9
15
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65
26
6
0
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1.15
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10
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28
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0
62
1.24
110897492--110897555
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3.4
19
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4
76
25
20
12
42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
64
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0
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16
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133
2.3
133
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0
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28
18
20
31
1.97
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88
2.1
88
92
0
313
26
19
19
34
1.96
110902049--110902191
44
3.2
44
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14
114
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18
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2.0
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18
22
32
1.97
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45
4.8
44
69
18
125
27
17
21
33
1.96
110906848--110907455
265
2.3
265
88
3
888
26
18
22
32
1.97
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1.9
134
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22
30
1.97
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5.5
44
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20
23
1.96
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35
20
21
22
1.96
110909053--110909181
15
8.9
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17
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3.8
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18
78
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1
64
1.30
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5.5
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21
83
28
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0
63
1.21
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2.1
16
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52
65
5
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2.2
26
86
0
76
46
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7
42
1.48
110913505--110913548
16
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13
1.43
110913650--110913831
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25.3
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68
15
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41
36
1
20
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110913650--110913683
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14
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59
35
50
0
14
1.44
110913721--110913831
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5.2
21
74
16
111
47
28
0
22
1.57
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14
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69
11
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0
23
1.57
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2.8
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19
22
29
1.98
110914404--110914510
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106
29
19
19
30
1.97
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2.6
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82
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1.94
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1.32
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0
0
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2.2
24
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0
3
27
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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105
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2
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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1.99
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.99
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2.7
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1.99
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1.98
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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