Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  304  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87513760--87513801
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25
2.7
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24
2.8
24
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10
79
38
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51
1.44
87514956--87515014
18
3.2
18
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5.0
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28
25
18
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1.98
87518791--87519036
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17
26
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1.97
87524541--87524721
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256
26
17
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0
0
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127
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1.84
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2.0
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0
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2.9
179
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1.96
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45
8.6
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73
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31
18
22
28
1.97
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45
3.6
45
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3
222
30
21
23
24
1.99
87543912--87544182
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3.1
89
78
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19
20
27
1.97
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127
1.8
127
90
0
374
30
16
16
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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4.2
26
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0
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10
1.70
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136
2.1
136
96
1
518
31
24
18
24
1.97
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26
4.2
26
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0
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4
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1.76
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19
2.0
20
90
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20
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65
50
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48
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1.11
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20
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32
4
2
60
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87607814--87607849
17
2.1
18
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2
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1.15
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2.2
38
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138
37
18
18
25
1.93
87634250--87634341
10
9.8
10
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25
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2
70
1.09
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28
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28
100
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2
69
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1.11
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0
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80
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22
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1.76
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Indices
Period
Size
Copy
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Percent
Indels
Score
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T
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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37
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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