Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  146  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39225451--39225644
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54
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1.8
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15
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6.4
8
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7
21
17
52
1.69
39229972--39230022
24
2.1
24
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68
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2.0
250
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27
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7.0
47
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29
28
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39250654--39250985
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2.3
144
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28
28
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34
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25
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2.4
80
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25
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24
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29
2.7
29
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0
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28
28
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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24
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0
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5
23
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39262051--39262101
8
6.4
8
77
8
59
5
23
19
50
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2.1
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0
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15
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25
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26
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21
31
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1.98
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4.2
39
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254
22
20
32
24
1.98
39285361--39285552
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251
22
21
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1.98
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16
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14
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3
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2.0
22
90
0
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16
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20
24
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1.97
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2.3
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4.8
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69
16
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11
3
22
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39325884--39325992
10
10.8
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30
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28
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1.99
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110
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1.98
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22
24
29
23
1.99
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3.2
40
84
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174
22
24
29
23
1.99
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3.2
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174
22
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29
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1.99
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22
24
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1.99
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27
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15
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80
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3
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12
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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50
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.98
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29
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1.98
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1.98
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1.98
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46
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216
28
28
21
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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