Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  386  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111854391--111854437
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25
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71
19
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2.8
92
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0
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20
21
1.98
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5.8
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11
269
29
29
20
21
1.98
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2
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0
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0
0
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2.2
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0
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17
19
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111883477--111883565
21
4.1
21
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5
90
53
10
23
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1.68
111883477--111883545
21
3.3
21
87
2
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8
24
11
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54
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16
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65
0
0
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2.0
125
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14
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36
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2.0
23
90
0
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46
4
13
35
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34
2.1
34
80
9
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2.5
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7
45
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111937713--111937757
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3.8
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82
11
58
57
4
0
37
1.19
111937711--111937757
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2.0
22
88
8
67
59
4
0
36
1.17
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4.8
76
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6
402
32
18
16
33
1.93
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90
2.0
88
83
6
219
32
19
19
28
1.96
111939433--111940919
312
4.9
306
72
18
1058
31
21
17
30
1.96
111939755--111940719
75
13.1
75
75
14
542
30
21
17
30
1.96
111939963--111940719
75
10.1
75
74
13
605
31
20
16
31
1.95
111939905--111940996
147
7.4
145
73
17
830
31
22
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111940184--111940358
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2.0
88
85
5
235
33
20
18
27
1.96
111939434--111940700
518
2.4
522
92
3
2070
31
20
16
31
1.95
111940360--111940484
63
2.0
64
93
1
216
26
24
16
32
1.96
111940303--111940700
138
2.8
140
82
6
509
29
21
16
32
1.95
111939394--111940996
450
3.6
448
85
8
1866
31
21
16
30
1.96
111940723--111940865
74
1.9
75
87
5
209
28
23
16
30
1.96
111940810--111940992
68
2.9
61
76
10
204
29
26
15
28
1.96
111941310--111941343
17
1.9
18
88
5
52
5
20
29
44
1.75
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0
50
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1.22
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0
0
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52
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23
34
1.94
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1.60
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23
2.0
25
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4
21
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111967527--111967575
24
2.0
24
84
0
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28
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0
84
23
0
26
50
1.50
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28
2.6
28
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2
94
29
31
13
25
1.94
111985888--111985931
18
2.4
18
80
0
52
34
18
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38
1.82
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20
2.5
20
100
0
100
38
26
14
22
1.91
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10
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0
0
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18
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27
0
2
70
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112013177--112013214
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2
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0
0
50
1.00
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3.0
18
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100
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0
0
50
1.00
112045181--112045535
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10
306
23
29
19
28
1.98
112045178--112045535
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3.8
94
77
10
347
23
29
19
28
1.98
112052628--112052661
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2.0
17
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52
47
0
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1.34
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10.7
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429
27
29
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27
1.96
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29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
112114710--112114853
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3.5
41
77
8
123
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20
20
22
1.94
112114816--112114953
41
3.4
41
82
4
170
39
22
18
18
1.92
112114960--112115069
47
2.4
45
80
3
121
48
33
0
18
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112115855--112116340
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115
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15
24
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1.94
112116418--112116547
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2.2
59
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20
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3
36
1.71
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0
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56
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17
0
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1.51
112118933--112119143
113
1.9
112
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361
48
17
0
33
1.51
112118912--112119156
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22
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2.0
27
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1.99
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2.1
22
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0
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0
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21
0
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2
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1.63
112124843--112124977
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2.4
57
84
0
171
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20
2
31
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
44
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1
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20
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1.97
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20
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1.98
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3.9
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21
26
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1.98
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2.3
128
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0
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22
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54
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25
100
0
104
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0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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2.7
29
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5
106
27
32
15
24
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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