Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr10 129486693 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  219  of  444  ( 53255 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61466869--61466983
29
4.0
28
83
8
135
28
31
13
26
1.94
61466860--61466970
58
1.9
57
87
5
161
27
32
14
25
1.94
61468880--61469059
30
6.1
30
84
11
248
48
14
17
19
1.81
61468880--61469059
85
2.1
85
97
0
342
48
14
17
19
1.81
61468880--61469041
6
26.8
6
78
15
174
48
14
17
19
1.80
61469199--61469297
27
3.7
26
86
5
117
36
21
22
20
1.95
61469455--61469519
22
3.0
22
80
8
78
33
23
23
20
1.97
61469944--61470255
27
11.3
27
83
5
338
23
19
20
35
1.96
61469980--61470247
143
1.9
143
89
1
421
23
20
21
35
1.96
61470240--61470587
27
13.1
27
76
10
157
33
7
23
35
1.84
61470107--61470282
54
3.3
53
85
6
203
22
18
21
37
1.94
61470393--61470563
79
2.1
79
91
4
236
38
7
25
29
1.82
61470393--61470608
79
2.7
79
84
2
209
37
6
24
31
1.82
61471920--61472097
24
7.1
24
80
14
209
48
14
16
19
1.80
61471920--61472097
6
29.5
6
77
16
172
48
14
16
19
1.80
61472257--61472354
27
3.7
26
83
8
108
36
21
21
20
1.95
61472512--61472576
22
3.0
22
77
8
69
35
21
23
20
1.96
61473001--61473312
27
11.3
27
83
5
329
24
19
20
35
1.95
61473037--61473304
143
1.9
143
89
4
416
23
20
20
35
1.96
61473297--61473646
27
13.1
27
77
8
166
32
7
24
35
1.83
61473164--61473339
54
3.3
53
84
6
194
23
18
21
37
1.94
61473450--61473646
81
2.4
81
91
0
313
36
6
25
31
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61473450--61473622
54
3.2
54
87
1
258
37
6
26
30
1.81
61481239--61481304
32
2.1
32
97
0
123
30
15
18
36
1.91
61482839--61482873
18
1.9
18
88
0
52
48
0
0
51
1.00
61485684--61485737
27
2.0
27
85
0
72
38
14
7
38
1.75
61488212--61488256
15
2.9
16
83
12
67
55
13
13
17
1.69
61488397--61488425
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
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61492286--61492349
27
2.4
27
81
0
74
39
15
6
39
1.73
61497737--61497781
20
2.3
20
84
3
56
28
15
26
28
1.96
61499462--61499505
19
2.4
19
96
3
81
25
18
11
45
1.82
61501313--61501349
20
1.9
18
89
10
56
37
5
8
48
1.56
61506497--61506548
25
2.1
24
89
3
77
28
40
9
21
1.84
61507657--61507709
22
2.3
23
87
9
74
24
1
3
69
1.15
61507657--61507716
21
2.8
22
80
16
72
25
1
3
70
1.12
61507862--61507914
20
2.8
20
85
5
65
60
3
0
35
1.15
61515271--61515557
47
6.1
47
89
2
405
33
11
29
25
1.91
61515271--61515557
96
3.0
94
88
3
405
33
11
29
25
1.91
61515393--61515467
22
3.3
22
66
23
64
32
13
29
25
1.93
61515531--61515667
46
3.0
46
87
0
193
35
10
30
24
1.88
61522024--61522173
79
1.9
81
83
8
200
30
29
19
21
1.97
61524273--61524328
26
2.2
26
93
6
96
12
19
25
42
1.86
61530763--61530880
39
3.0
39
97
0
218
21
25
30
22
1.99
61534209--61534389
40
4.6
40
76
9
165
24
23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61536587--61536856
46
5.7
47
78
8
234
26
18
30
24
1.98
61536677--61536852
96
1.8
96
87
6
264
25
18
31
25
1.97
61536590--61536860
146
1.9
140
84
7
357
26
18
29
25
1.98
61538766--61538805
21
1.9
21
94
0
71
32
12
10
45
1.75
61548411--61548510
40
2.5
40
88
3
139
23
18
25
34
1.96
61548480--61548598
41
2.9
42
81
5
125
26
14
27
31
1.95
61549952--61549985
17
2.0
17
100
0
68
41
11
11
35
1.78
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40
5.2
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1
209
25
25
22
26
2.00
61555028--61555233
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
61557622--61557690
28
2.5
28
90
6
106
20
8
26
44
1.80
61562220--61562400
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3.9
46
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9
233
20
21
29
27
1.98
61562222--61562392
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
61567162--61567324
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2.3
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1
319
19
28
17
34
1.94
61567162--61567358
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28
17
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1.95
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2.3
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100
0
328
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28
17
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1.94
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20
28
17
33
1.95
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25
22
25
25
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2.00
61584048--61584146
28
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29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
61591177--61591221
23
2.0
22
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4
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17
13
20
48
1.80
61594255--61594279
13
1.9
13
100
0
50
32
4
16
48
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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0
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12
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19
1.88
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26
2.7
27
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1
0
40
1.07
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3
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0
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0
0
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19
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2
0
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1.10
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1
0
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1.07
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10
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10
100
0
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22
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1.99
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3.5
40
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255
29
28
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1.98
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2.0
37
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1.94
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20
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5
1
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1.34
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22
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4
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61634976--61635006
2
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0
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0
0
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1.00
61635481--61635525
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1.9
23
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4
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17
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17
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1.94
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20
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0
0.95
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1.23
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2
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2.2
22
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0
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45
10
10
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20
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19
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19
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51
5
0
42
1.25
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23
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1
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1.16
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2.0
31
81
6
74
33
1
17
47
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
50
1.00
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4
0
34
1.16
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1.9
19
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2.0
20
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1.8
124
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1
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1.94
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24
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1.94
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1.99
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24
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16
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26
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20
23
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1.96
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25
20
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1.96
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2.8
81
86
1
259
26
18
19
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61755597--61755775
27
6.6
27
84
0
232
30
7
20
40
1.81
61755594--61755775
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3.4
54
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0
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8
20
40
1.82
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3.5
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2
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25
26
1.93
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1.78
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2
90
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1.96
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2.00
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2.00
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4.2
40
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2
176
24
27
22
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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