Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  432  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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2.1
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2.9
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2.8
28
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42
0
2
54
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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2.4
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66
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6
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2.2
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2.8
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18
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1.8
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229
23
14
26
35
1.94
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4.9
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22
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55
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2.0
24
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19
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0
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0
0
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1.92
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3.1
37
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25
17
33
1.96
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2.0
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307
23
24
16
34
1.95
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3.1
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1.94
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4.4
85
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477
28
14
20
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125173050--125173430
171
2.2
171
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6
511
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13
20
37
1.91
125175094--125175155
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2.5
24
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37
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0
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2.3
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3
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2.1
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3
58
1.38
125175312--125175390
37
2.1
39
83
7
99
32
5
3
58
1.38
125175350--125175440
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30
7
4
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1.47
125175348--125175446
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4.2
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2.2
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2.0
22
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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