Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  76  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18032006--18032504
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185
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29
1.96
18074224--18074701
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128
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725
21
32
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29
1.96
18081178--18081292
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
45
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26
1.94
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18
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16
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144
29
23
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1.93
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2.0
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2
0
21
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18145214--18145380
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19
19
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232
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20
19
32
1.97
18145437--18145614
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4.0
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17
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1.9
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40
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3
204
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17
23
1.94
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26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18206994--18207103
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
18212763--18212872
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
18213730--18213781
19
2.7
20
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28
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0
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50
0
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27
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0
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7
12
40
1.71
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1.9
241
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9
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9
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1.59
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22
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1.07
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2
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1.20
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12
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0
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1.18
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0
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1.22
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0
0
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0
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0
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1.22
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1.9
25
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0
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18242303--18242404
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2.1
49
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28
1.57
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4.2
6
100
0
50
16
68
0
16
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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34
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0
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0
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17
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30
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1.9
73
95
0
245
29
17
25
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18281313--18281473
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73
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1.95
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1
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26
17
22
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1.95
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1.95
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26
17
21
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1.95
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2.2
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1
229
26
15
20
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18
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1.94
18281875--18282455
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2.7
23
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17
69
39
1
7
51
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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