Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  81  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19147668--19147709
2
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2
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2
2
47
1.28
19148134--19148189
23
2.3
23
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12
30
1.72
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121
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0
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0
0
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0
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1.00
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0
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0
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0
0
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21
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2.1
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50
27
0
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18
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10
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35
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2.7
37
84
12
132
37
9
17
35
1.82
19161431--19161521
19
4.9
19
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143
37
9
16
36
1.82
19161431--19161544
19
5.8
22
84
10
78
36
8
16
37
1.80
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18
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56
29
0
0
70
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2.0
22
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47
4
0
47
1.21
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1.9
23
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9
63
45
6
0
47
1.29
19175617--19175789
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3.7
45
81
14
192
25
30
16
27
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12
2.1
12
100
0
50
60
16
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16
1.58
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14
2.1
14
93
6
51
24
6
0
68
1.13
19184446--19184517
3
24.7
3
89
10
114
29
0
1
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0.97
19185054--19185088
3
11.7
3
87
0
52
28
2
2
65
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19185139--19185226
3
28.0
3
84
8
113
30
1
1
67
1.06
19186987--19187136
41
3.7
40
78
7
160
19
21
36
23
1.95
19187038--19187159
41
3.0
41
80
2
120
18
18
35
27
1.95
19191519--19191730
115
1.9
115
81
5
259
50
11
5
32
1.61
19192120--19192205
7
12.3
7
79
16
90
68
1
1
29
1.04
19192121--19192224
21
5.2
20
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15
76
65
0
1
31
1.10
19192314--19192368
29
2.0
27
85
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74
65
0
1
32
1.03
19192313--19192368
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2.2
25
87
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76
66
0
1
32
1.03
19193826--19194706
132
6.9
130
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4
1001
27
27
13
30
1.94
19193826--19194600
44
17.8
44
84
2
974
26
27
14
30
1.95
19194574--19194628
28
2.0
28
100
0
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2.0
72
91
0
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31
13
29
1.93
19194602--19194706
44
2.4
44
88
0
147
30
27
10
31
1.90
19194486--19194706
116
1.9
116
90
0
352
27
28
13
31
1.94
19196448--19196478
16
1.9
16
100
0
62
29
38
12
19
1.89
19206135--19206346
115
1.9
115
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5
250
50
11
6
31
1.63
19206745--19206806
7
9.0
7
75
19
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59
0
3
37
1.13
19206746--19206872
23
5.4
23
71
22
95
59
0
3
35
1.21
19206902--19206956
29
2.0
27
85
7
74
65
0
1
32
1.03
19206901--19206956
27
2.2
25
87
6
76
66
0
1
32
1.03
19215036--19215079
22
2.0
22
83
12
56
56
6
6
29
1.51
19215394--19215481
10
8.7
10
71
19
58
61
1
1
36
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19215394--19215475
15
4.9
16
76
16
69
62
1
1
35
1.11
19215262--19215481
23
8.5
25
68
24
95
58
0
5
35
1.25
19215460--19215517
26
2.2
27
82
11
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60
1
1
36
1.17
19217109--19217656
206
2.7
206
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22
17
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1.97
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1
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1
76
0
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4
4
87
0.74
19218552--19218608
13
4.4
13
84
0
78
1
5
5
87
0.72
19218555--19218622
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1.9
35
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3
91
4
5
5
83
0.89
19229597--19229640
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2.0
22
83
12
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56
6
6
29
1.51
19229755--19229829
14
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15
70
23
59
57
2
8
32
1.42
19229778--19229944
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42
70
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53
1
6
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1.35
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10
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1
1
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1.11
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2.0
27
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10
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0
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1.15
19229884--19230043
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19233912--19233963
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27
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68
26
5
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44
1.76
19233912--19233988
18
4.3
18
76
3
66
27
6
20
45
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19234434--19234495
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9
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1
1
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18
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17
72
13
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2
1
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1.17
19234411--19234510
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27
75
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4
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1.19
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0
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0
0
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1
0
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1.02
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0
0
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20
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18
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19252970--19253006
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19
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0
0
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0
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0
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18
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10
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27
19
8
44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19291145--19291194
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12
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54
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0
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1.98
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1.97
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178
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26
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1.00
19302430--19302472
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0
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0.89
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2.2
22
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22
2
2
72
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20
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1.95
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2.4
22
80
14
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43
1
5
49
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19333974--19334029
2
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2
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1
3
48
1.30
19335886--19336013
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1.97
19340921--19341080
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20
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0
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0
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11
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0
20
0
0.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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