Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  106  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26189797--26189853
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0
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14
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200
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19
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10
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6
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2.2
27
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7.5
73
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227
2.6
228
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857
29
17
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39
100
0
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25
2.2
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87
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84
27
12
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1.51
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0
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0
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2.0
45
88
0
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5
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18
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2.0
26
84
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2.0
44
97
0
169
24
14
19
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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5
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2.1
19
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0
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28
10
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1.89
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2.1
18
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0
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51
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10
29
1.65
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3.0
84
80
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277
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25
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27
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26259273--26259503
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5.5
42
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30
24
16
28
1.96
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48
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207
25
23
19
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1.98
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17
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22
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20
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9
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2.0
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3
48
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20
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0
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16
24
29
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2.0
20
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30
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32
2.5
32
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101
29
2
18
49
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2.4
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51
63
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5
31
1.17
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20
2.5
22
82
11
60
62
1
3
31
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26335273--26335330
20
2.7
22
82
15
68
29
29
0
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1.56
26337012--26337076
29
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78
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71
30
43
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1.78
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18
2.4
18
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27
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1.82
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116
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4.3
126
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17
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1.96
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252
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17
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28
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1.97
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18
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25
100
0
104
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21
15
11
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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53
3
3
40
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
29
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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0
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20
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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