Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  130  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34058725--34058778
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2.1
26
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0
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1.8
124
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29
23
1.99
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2.5
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0
0
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2.2
119
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0
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20
17
25
36
1.94
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143
1.9
143
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0
496
20
17
25
36
1.94
34122386--34122651
24
11.1
24
97
0
480
20
17
25
36
1.94
34127516--34127662
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23
2.00
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2.1
78
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7
203
25
22
27
25
2.00
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3.2
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135
27
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25
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0
0
50
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12
61
14
4
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14
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2
2
17
0.97
34161938--34161979
18
2.3
19
91
4
68
71
0
2
26
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
38
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11
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15
23
28
1.95
34166277--34166308
14
2.2
15
94
5
57
62
3
12
21
1.43
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49
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50
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188
24
1
22
50
1.59
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14
2.9
14
85
0
64
21
7
31
39
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22
2.1
22
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31
0
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28
2.0
28
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2.3
22
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10
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33
14
14
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44
41
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1.44
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80
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9
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43
30
2
23
1.66
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7
40.3
7
71
16
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45
29
2
22
1.66
34198964--34199250
14
19.7
15
68
11
89
44
29
2
22
1.67
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22
3.5
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15
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50
28
0
20
1.48
34199212--34199268
29
2.0
29
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31
0
19
1.49
34199651--34199691
3
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100
0
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0
0
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18
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1.94
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9
28.0
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0
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289
45
23
0
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2.0
27
100
0
110
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7
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14
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51
37
0
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55
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222
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20
23
30
1.99
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2.4
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26
21
23
29
1.99
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42
6.3
42
79
7
229
26
20
22
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34210727--34210756
14
2.1
15
93
6
53
50
0
3
46
1.18
34212194--34212233
21
1.9
21
85
10
55
27
20
25
27
1.99
34214214--34214415
29
7.1
27
71
18
103
34
2
2
60
1.25
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30
2.4
29
81
4
83
31
2
2
63
1.23
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36
2.6
37
81
18
121
35
0
2
62
1.07
34214226--34214413
20
9.6
20
68
23
80
34
3
2
59
1.27
34214240--34214415
3
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3
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3
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12
53
21
24
10
43
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15
3.5
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17
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24
24
10
40
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4.7
210
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1642
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30
1.97
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1.96
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58
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133
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35
0
0
64
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27
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18
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34
1
2
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
74
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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