Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  375  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109012610--109012643
4
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4
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6
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0
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0
0.83
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2.4
47
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6
154
25
16
23
35
1.95
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13
2.6
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4
50
72
0
27
0
0.85
109019860--109019893
4
8.2
4
87
6
50
73
0
26
0
0.83
109020650--109020760
47
2.4
47
84
6
154
25
16
23
35
1.95
109026049--109026085
19
1.9
19
88
0
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43
18
13
24
1.86
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3.0
25
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15
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20
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109026071--109026174
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16
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2.0
153
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30
19
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109028377--109028415
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3.1
13
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20
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109034068--109034107
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1.9
21
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10
55
55
2
10
32
1.47
109035024--109035064
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2.4
18
80
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50
65
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24
1.30
109039224--109039322
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2.8
37
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100
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40
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13
111
34
25
4
35
1.77
109039461--109039555
46
2.1
47
86
9
135
34
26
4
34
1.76
109039537--109039607
16
4.4
16
92
0
115
28
25
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1.82
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19
1.9
17
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11
52
54
5
5
34
1.48
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2.0
31
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106
45
9
9
34
1.70
109051051--109051096
23
2.0
23
91
0
74
63
2
2
32
1.19
109051053--109051096
11
3.9
11
82
5
52
63
2
2
31
1.19
109051113--109051185
10
7.8
9
73
13
58
67
2
1
28
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109051145--109051185
20
2.1
20
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4
75
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0
0
31
0.90
109051118--109051186
18
3.7
18
78
16
70
68
2
0
28
1.04
109051629--109051671
19
2.3
19
79
0
50
34
0
2
62
1.08
109051977--109052013
2
19.0
2
94
5
67
48
0
0
51
1.00
109054648--109054682
16
2.2
16
90
10
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45
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14
31
1.75
109057111--109057156
24
2.0
23
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19
2
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30
1.61
109057217--109057249
6
5.5
6
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0
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18
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4.4
53
78
8
235
36
18
23
21
1.94
109062113--109062152
20
2.0
20
85
0
53
40
2
17
40
1.63
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17
2.0
17
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59
50
0
0
50
1.00
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0
0
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52
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11
30
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3.5
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17
51
45
0
3
50
1.18
109068319--109068362
18
2.5
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10
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59
0
0
40
0.98
109071684--109071717
16
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52
64
0
2
32
1.08
109072076--109072123
15
3.1
15
88
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29
2
0
68
1.01
109072076--109072123
16
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16
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3
71
29
2
0
68
1.01
109072455--109072509
20
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23
1
1
72
1.04
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92
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43
2
15
38
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15
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1
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2
61
1.11
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3.3
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80
14
51
46
0
2
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109073181--109073221
20
2.0
22
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2
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109075160--109075212
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21
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0
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16
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1.96
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22
2.3
23
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0
26
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1.51
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12
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0
0
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0
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0
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1.07
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2.8
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71
2
1
23
1.07
109089555--109089631
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2.2
33
86
6
100
71
2
1
24
1.06
109089554--109089628
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2.5
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10
93
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2
1
25
1.08
109089558--109089631
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78
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24
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1.08
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18
2.0
18
100
0
72
66
16
5
11
1.40
109161398--109161428
5
6.2
5
100
0
62
58
0
0
41
0.98
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23
2.2
24
93
3
88
23
5
21
50
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109186375--109186401
13
2.1
13
100
0
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0
14
51
1.43
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14
2.1
15
93
6
53
56
13
10
20
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27
8.8
27
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4
219
28
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14
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1.84
109193865--109194088
80
2.8
81
83
3
274
28
14
14
42
1.85
109193843--109194088
107
2.3
107
80
4
273
28
15
14
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1.85
109194433--109194484
18
2.9
18
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0
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19
19
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1.77
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27
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1.95
109200166--109200328
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1.9
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204
28
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1.96
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19
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19
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1.9
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1.80
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0
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109224131--109224188
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0.92
109224138--109224187
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12
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0.97
109224132--109224187
17
3.2
17
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5
76
8
5
3
82
0.94
109224131--109224194
23
2.7
23
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6
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109239394--109239441
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2.3
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0
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16
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1.87
109239394--109239464
21
3.4
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18
21
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109239731--109239792
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2.1
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1.88
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2.3
43
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0
124
20
17
33
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109244789--109244840
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1
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1.20
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1.9
22
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0
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0
7
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1.22
109245743--109245780
13
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0
2
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19
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2
2
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109245902--109245950
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119
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1.97
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4.1
206
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0
0
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0
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0
0
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1.9
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0
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1.00
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0
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1.11
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2.2
24
82
14
64
54
0
3
42
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109273690--109273843
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0
4
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1.20
109273687--109273824
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0
5
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1.25
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1.96
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1.9
41
82
7
97
63
2
3
30
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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