Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  298  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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28
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0
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0
0
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2.2
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12
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0
0
56
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0
0
55
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2.0
28
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0
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18
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145
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0
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18
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1.45
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2.1
30
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0
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1.49
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13
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14
1.9
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100
0
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29
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1.9
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24
12
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2.8
24
66
26
57
28
6
3
61
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
26
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66
26
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4
63
1.38
86221540--86221657
3
39.3
3
71
9
80
28
5
2
62
1.32
86223118--86223226
26
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26
91
0
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23
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36
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0
0
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1.97
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21
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21
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20
20
22
1.96
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18.3
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0
0
33
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19
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25
1.99
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573
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13
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10
16
35
1.82
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19
1.9
19
94
0
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37
10
13
37
1.80
86273106--86273139
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1.9
17
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5
50
29
0
0
70
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0
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1
0.73
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105
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0
16
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0.75
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15
3.4
16
84
7
74
83
0
16
0
0.66
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32
2.2
34
80
13
68
82
0
15
1
0.73
86276303--86276376
9
8.9
8
76
20
64
82
0
16
1
0.74
86276300--86276378
22
3.8
22
80
11
87
83
0
15
1
0.71
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8.4
84
93
1
1211
29
22
22
25
1.99
86278148--86278378
87
2.6
87
84
5
279
31
19
23
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86278935--86279013
36
2.1
38
88
9
117
36
10
17
35
1.84
86278935--86279013
19
4.2
19
88
9
117
36
10
17
35
1.84
86278935--86279030
19
4.9
21
84
8
91
34
10
17
37
1.84
86281024--86281053
15
2.0
15
93
0
51
60
0
3
36
1.14
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37
2.0
37
92
0
123
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9
5
22
1.45
86283184--86283244
24
2.6
23
82
12
70
59
4
6
29
1.44
86283198--86283243
23
2.0
24
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58
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1.43
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2.0
48
98
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187
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1.51
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34
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22
19
1.96
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3.6
41
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1
193
26
20
24
28
1.99
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3.5
14
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18
0
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1.49
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7
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18
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40
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23
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1
20
41
1.64
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234
2.5
234
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1.97
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200
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20
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20
18
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20
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53
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200
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15
15
30
1.90
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13
2.1
13
100
0
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22
0
7
70
1.12
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5
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5
100
0
68
0
17
0
82
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
0
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1.83
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19
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1.83
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19
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0
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25
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28
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1.97
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1.95
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43
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132
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18
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1.95
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2.1
14
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0
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56
6
16
20
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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0
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412
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1.97
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3.9
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161
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4.3
207
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0.82
86406000--86406116
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11
0
82
0.81
86406000--86406116
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5
11
0
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34
10
13
41
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86414988--86415035
19
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19
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1.75
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2.5
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1
162
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15
12
35
1.85
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17
5.3
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15
10
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1.82
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21
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20
1.98
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2.9
39
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0
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28
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1.99
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1.98
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20
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1.96
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1.95
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3.3
87
87
1
402
35
20
23
20
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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