Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  422  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122082312--122082363
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2.3
22
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1.9
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0
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27
23
1.98
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7.6
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209
27
19
28
25
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122092151--122092323
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1.8
94
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28
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1.98
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27
18
28
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2.4
24
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2.3
30
82
0
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40
1
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50
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2.0
20
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2.5
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86
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19
2
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1.65
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20
3.2
20
75
9
56
59
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1.28
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19
2.6
19
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10
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10
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73
34
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3
58
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2.1
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85
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87
35
6
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55
1.40
122111388--122111470
19
4.2
20
71
20
59
33
2
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1.16
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2.3
43
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28
24
19
26
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2.3
21
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62
2
54
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22
1.55
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9
10.6
9
74
12
85
30
0
20
47
1.57
122118906--122119006
30
3.5
30
79
8
109
30
0
20
47
1.57
122118930--122118989
21
3.0
21
73
14
72
30
0
23
46
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122119695--122119723
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2.0
39
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0
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51
15
11
21
1.74
122121207--122121269
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3.3
19
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12
56
49
17
12
20
1.79
122123219--122123299
37
2.2
37
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0
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2
0
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2.1
15
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0
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6
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3
16
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122123339--122123405
28
2.4
27
82
9
73
50
31
1
16
1.54
122123682--122123732
23
2.2
23
79
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45
21
3
29
1.70
122124869--122124901
16
2.1
16
94
0
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45
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100
0
50
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0
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2.1
18
95
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2
47
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2.1
36
94
2
130
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8
52
1.67
122135537--122135653
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2.1
57
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0
153
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13
41
1.85
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73
37
12
13
36
1.82
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17
8.6
17
77
18
142
37
12
13
36
1.82
122142906--122143048
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4.3
35
79
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180
37
12
13
36
1.82
122142960--122143009
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2.0
25
100
0
100
40
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36
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2.0
61
96
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228
38
13
11
36
1.80
122142940--122143027
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2.0
43
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142
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13
11
37
1.81
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78
18
156
36
11
14
38
1.81
122143525--122143575
17
2.9
18
75
16
61
39
1
0
58
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122146678--122146778
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47
2
17
31
1.63
122146678--122146750
27
2.7
28
87
8
107
46
2
17
32
1.63
122146689--122146781
39
2.3
40
83
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125
49
2
18
30
1.59
122146689--122146781
13
7.0
13
77
12
100
49
2
18
30
1.59
122150763--122150827
28
2.3
28
89
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20
1.93
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4.5
45
79
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192
23
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19
27
1.98
122151799--122152061
94
2.8
91
78
12
270
23
28
19
27
1.99
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20
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2.3
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10
134
50
4
9
36
1.55
122195582--122195638
22
2.6
22
85
0
78
29
21
24
24
1.99
122197197--122197237
21
2.0
21
100
0
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39
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24
17
1.92
122198521--122198566
24
1.9
24
82
8
58
50
4
28
17
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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2.0
101
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20
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1.94
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15
2.0
15
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0
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19
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24
0
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0
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0
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1.10
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122242914--122243028
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122254166--122254294
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122257772--122257812
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6
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0
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0
17
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0
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2.0
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0
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0
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0
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0
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0
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0
0
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1.95
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3.4
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83
2
340
27
18
18
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122333757--122334086
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2.5
133
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19
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2.0
20
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5
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1.39
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5.3
9
82
10
53
59
0
6
34
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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