Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  221  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62055124--62055341
54
4.0
54
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5
199
22
22
16
37
1.94
62055145--62055347
109
1.9
108
82
5
257
23
22
17
36
1.95
62055531--62055617
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2.0
44
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4
113
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62065915--62065945
9
3.4
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100
0
62
22
0
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1.19
62067766--62067932
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3.6
45
75
9
156
23
28
19
29
1.98
62067765--62067935
94
1.8
92
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236
23
28
19
28
1.98
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2
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0
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1.34
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19
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3
80
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2
12
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2.0
42
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0
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0
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100
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2
100
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50
0
0
50
1.00
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19
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36
2.0
36
86
10
101
38
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14
39
1.76
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8.4
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12
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0
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0
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0
9
0
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9
288
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18
24
25
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62101382--62101824
132
3.4
132
91
0
683
31
18
24
26
1.97
62101768--62101860
44
2.1
44
91
0
150
34
16
24
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62101846--62102561
205
3.5
205
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1
1193
30
18
22
28
1.97
62102635--62102740
45
2.4
45
82
7
119
34
10
30
24
1.89
62103101--62103161
19
3.3
19
93
6
108
37
8
16
37
1.78
62104136--62104185
25
2.0
25
100
0
100
40
16
16
28
1.89
62104641--62104686
21
2.2
21
100
0
92
63
10
13
13
1.53
62104648--62104696
21
2.3
21
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0
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63
8
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6
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62106657--62106693
19
1.9
19
88
0
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59
2
2
35
1.26
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21
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23
82
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71
63
0
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32
1.12
62106703--62106741
12
3.4
11
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10
60
64
0
2
33
1.08
62106706--62106753
15
3.2
16
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50
64
0
2
33
1.05
62106666--62106755
19
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20
74
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62
1
2
34
1.15
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13
225
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29
21
20
1.98
62112827--62112997
93
1.8
92
96
1
315
27
30
21
20
1.98
62112824--62113012
46
4.1
45
73
12
152
28
29
21
20
1.98
62114465--62114657
30
6.4
30
79
4
201
25
29
10
34
1.90
62115010--62115071
31
2.0
31
96
0
115
29
37
9
24
1.87
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84
3.7
83
87
2
434
46
10
9
32
1.72
62120068--62120297
88
2.6
87
80
6
223
40
11
12
35
1.80
62119773--62120186
166
2.5
163
80
6
395
45
11
9
33
1.74
62120352--62120518
88
1.9
87
86
6
239
44
9
13
32
1.75
62121242--62121282
21
2.0
21
90
4
66
41
4
14
39
1.67
62123335--62123395
30
2.0
30
93
0
104
19
47
1
31
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62124733--62124797
31
2.1
31
85
0
85
49
23
3
24
1.64
62134022--62134074
26
2.0
27
88
7
81
35
1
3
58
1.27
62134024--62134080
28
2.2
27
81
12
66
36
1
5
56
1.32
62134921--62134950
2
15.0
2
92
0
51
53
0
0
46
1.00
62141751--62141934
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3.7
50
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1
226
29
26
17
25
1.98
62141751--62141934
101
1.8
99
87
2
269
29
26
17
25
1.98
62142180--62142233
27
2.0
27
85
0
72
37
14
7
40
1.74
62144824--62144932
26
4.2
26
93
0
191
32
7
25
34
1.84
62150611--62150711
26
3.9
26
96
1
186
30
5
26
36
1.80
62156320--62156424
25
4.2
26
95
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180
31
4
25
38
1.77
62156320--62156424
51
2.1
50
94
5
185
31
4
25
38
1.77
62160104--62160146
21
2.1
21
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4
61
18
16
32
32
1.93
62162787--62162940
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42
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5
175
31
14
24
29
1.94
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19
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44
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28
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0
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0
0
1.00
62204790--62204817
2
14.0
2
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0
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0
0
50
1.00
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20
2.0
20
89
0
60
76
2
5
15
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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0
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100
0
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0
0
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1.00
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2
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1
0
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0
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17
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0
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1.98
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24
24
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23
2.00
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1.99
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23
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1.99
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20
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1.99
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1.95
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1.98
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1.98
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1.99
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1.98
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1.9
79
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2
184
24
31
20
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62299943--62300066
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39
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1.97
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35
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22
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1.93
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24
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26
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22
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1.99
62306712--62306855
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25
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26
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1.8
151
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1.97
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0
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1.99
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3.0
37
76
14
103
22
20
24
32
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62348736--62348780
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20
100
0
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0
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1.96
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20
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1.31
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38
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2.6
15
95
0
69
48
15
20
15
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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