Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  117  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29923192--29923222
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15
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0
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40
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0
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27
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93
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21
1.98
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3.7
46
80
13
219
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
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1.88
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25
29
18
26
1.98
30032318--30032632
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140
80
12
326
25
30
18
25
1.98
30032316--30032679
94
3.9
93
78
10
298
25
29
18
26
1.98
30032313--30032677
140
2.6
140
80
7
346
25
29
18
26
1.98
30035653--30035706
27
2.0
27
100
0
108
14
14
37
33
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1.60
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33
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1.96
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71
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0
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3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
21
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0
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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25
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25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30148779--30148855
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1.87
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1.99
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54
0
0
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0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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