Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  405  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117695501--117695609
51
2.1
52
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1
193
33
5
24
36
1.79
117701277--117701410
26
5.2
26
94
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218
33
5
24
36
1.78
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2.3
11
100
0
50
36
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1.77
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2
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0
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0
0
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0
51
0
2
10
87
0.65
117721559--117721603
12
3.9
12
82
11
58
48
40
0
11
1.39
117721557--117721602
22
2.1
22
91
0
74
45
43
0
10
1.39
117721557--117721590
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50
0
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16
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2
62
1.35
117722167--117722291
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5.7
22
75
15
82
30
6
1
61
1.30
117722453--117722490
20
1.9
20
89
10
60
26
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2
63
1.35
117722664--117722925
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2.1
127
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3
341
34
11
17
36
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3.2
133
90
0
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31
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21
25
1.98
117729128--117729492
177
2.1
177
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425
31
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21
25
1.98
117729484--117729836
177
2.0
177
82
5
428
30
20
22
26
1.98
117729658--117729743
44
2.0
44
88
0
127
30
18
24
26
1.98
117729118--117729836
310
2.3
308
81
5
772
31
20
21
25
1.98
117729262--117729758
133
3.7
132
84
4
545
31
21
21
25
1.98
117729887--117730097
45
4.8
45
73
4
126
29
16
25
28
1.96
117729834--117730097
133
2.0
134
84
2
343
30
16
24
28
1.97
117729839--117730121
134
2.1
133
82
3
336
30
18
22
28
1.97
117730611--117730655
12
3.9
12
82
11
67
44
46
0
8
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117730604--117730664
22
2.6
23
89
10
97
42
47
0
9
1.36
117731092--117731451
3
119.7
3
69
18
128
28
6
3
60
1.40
117731212--117731291
23
3.4
23
79
10
65
28
5
2
63
1.28
117731473--117731527
18
3.1
17
82
10
65
27
5
0
67
1.12
117731477--117731520
21
2.1
21
86
0
61
25
4
0
70
1.06
117732995--117733040
23
2.0
23
83
4
58
47
15
6
30
1.70
117733537--117733565
8
3.8
8
95
4
51
37
0
0
62
0.96
117733537--117733569
13
2.3
15
90
10
52
39
0
0
60
0.97
117733642--117733680
14
2.9
14
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3
53
71
0
28
0
0.86
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24
2.2
24
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6
70
21
26
23
28
1.99
117737626--117737671
14
3.1
15
81
9
58
50
4
15
30
1.63
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594
2.0
597
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1
2143
31
17
16
33
1.93
117753356--117753393
13
2.7
14
80
11
51
23
0
2
73
0.95
117754088--117754117
14
2.1
15
93
6
53
40
0
6
53
1.27
117759434--117759463
13
2.3
13
94
0
51
30
6
3
60
1.39
117761699--117761746
26
1.9
24
87
8
69
29
0
6
64
1.18
117767148--117767467
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7.0
46
92
0
498
22
24
14
38
1.92
117775936--117776055
45
2.7
43
76
8
107
30
17
20
31
1.95
117775848--117776143
89
3.3
87
68
9
247
30
20
21
28
1.98
117775988--117776297
133
2.3
133
86
2
428
30
20
21
27
1.98
117776023--117776211
44
4.3
45
69
7
136
29
20
22
28
1.98
117776135--117776410
89
3.1
88
65
13
224
30
19
22
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117775868--117776408
176
3.1
178
80
4
479
30
19
22
27
1.98
117776114--117776450
176
1.9
175
88
1
505
29
20
22
27
1.98
117784455--117784489
10
3.6
10
88
7
54
62
8
0
28
1.24
117785950--117785974
3
8.3
3
100
0
50
36
32
0
32
1.58
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13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
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17
2.2
18
90
9
60
40
0
5
54
1.24
117793837--117793897
32
1.9
32
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0
113
49
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4
29
1.66
117793837--117793910
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10
91
50
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5
28
1.67
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15
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12
1.68
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2.0
22
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0
0
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1.00
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0
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10
59
56
0
0
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54
0
0
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1
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18
20
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38
4.7
38
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4
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34
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20
20
1.96
117815372--117815469
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48
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0
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0
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117817824--117818092
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29
19
27
1.98
117817778--117818092
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142
80
8
340
23
28
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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24
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0
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10
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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198
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0
0
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0
0
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2.0
22
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2
0
58
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.98
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0
0
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9
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35
1
0
63
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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