Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  42  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10323321--10323363
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121
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1.9
30
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73
20
31
25
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
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18
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51
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26
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81
2.1
81
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19
25
20
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1.97
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19
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1.97
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283
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20
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1.96
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1.9
46
88
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26
26
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1.96
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0
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0
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0
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20
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1.90
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1.82
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21
1.9
22
90
5
66
12
7
12
68
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10438494--10438534
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19
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0
26
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24
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2
2
44
1.24
10439141--10439230
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2.5
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35
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1.17
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2.2
16
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9
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33
11
0
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16
2.2
16
100
0
70
31
11
11
45
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
1
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1.09
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0
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25
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26
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1.92
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0
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18
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1.94
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34
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18
28
1.94
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1.93
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2
210
28
14
25
32
1.94
10521791--10522002
87
2.4
88
80
3
221
28
14
25
32
1.94
10525179--10525230
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12
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2.2
25
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5
16
1
75
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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24
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26
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28
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1.11
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0
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1.01
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17
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1.87
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2.0
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1
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1.96
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2.0
21
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0
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2.0
22
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1.57
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1.54
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0
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0
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0
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0
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0
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0.96
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0
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0.95
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3.8
46
78
14
202
20
20
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10541729--10541899
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94
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21
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28
1.98
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20
21
29
28
1.98
10549296--10549467
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1.8
93
96
0
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20
21
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1.98
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1.96
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1.99
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1.99
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20
92
0
100
37
11
20
30
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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