Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  444  ( 53255 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Indices
Period
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Consensus
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Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6046802--6046897
11
8.1
11
69
22
61
59
1
6
33
1.29
6046872--6046911
17
2.4
16
84
12
53
67
2
0
30
1.04
6046965--6047000
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
6046996--6047033
17
2.2
18
86
13
53
55
15
2
26
1.54
6047025--6047076
3
17.0
3
80
4
59
59
1
3
34
1.27
6047099--6047151
22
2.4
22
83
3
61
45
0
0
54
0.99
6048453--6048587
26
5.2
26
96
0
236
33
4
25
37
1.76
6054265--6054398
26
5.2
25
96
2
223
33
4
25
36
1.76
6054265--6054398
51
2.6
51
95
1
232
33
4
25
36
1.76
6057849--6057874
3
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3
100
0
52
65
0
0
34
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6058371--6058398
3
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3
100
0
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0
0
67
0.91
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2.0
28
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0
103
28
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14
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1.87
6064177--6064260
26
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26
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0
150
33
4
25
36
1.77
6069065--6069101
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
6071603--6071661
29
2.0
30
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3
84
28
6
15
49
1.70
6073955--6074012
3
19.3
3
100
0
116
67
0
0
32
0.91
6074016--6074107
6
15.3
6
83
0
85
52
4
42
1
1.28
6074189--6074255
21
3.2
21
78
4
64
53
1
40
4
1.30
6074192--6074255
15
4.6
14
73
11
51
54
1
39
4
1.31
6074031--6074311
151
1.9
152
87
0
420
40
9
29
19
1.84
6074631--6074659
2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
6076783--6077001
33
6.7
33
75
7
124
31
22
12
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6076814--6077017
98
2.1
99
81
4
252
30
24
10
34
1.90
6076874--6077020
33
4.5
33
75
6
138
29
24
10
35
1.88
6077709--6077756
21
2.2
22
82
14
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35
16
0
47
1.47
6084131--6084163
14
2.4
14
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0
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0
3
33
1.10
6084461--6084506
22
2.2
21
81
14
51
43
2
17
36
1.61
6085162--6085277
40
2.9
41
85
3
146
37
9
15
37
1.80
6090194--6090380
50
3.7
50
83
7
223
25
16
28
29
1.97
6093912--6093990
41
1.9
41
82
10
99
20
39
25
15
1.91
6101084--6101188
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2.0
52
100
0
210
34
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30
25
1.88
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2.1
19
100
0
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50
7
15
27
1.70
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3
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3
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20
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65
1
3
29
1.15
6103410--6103494
18
4.7
18
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13
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1
3
29
1.16
6103405--6103491
27
3.4
27
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19
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1
3
29
1.16
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26
2.0
26
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26
1
19
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1.9
22
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5
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68
19
0
12
1.21
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176
5.3
176
79
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25
22
19
32
1.97
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132
5.4
132
95
0
1253
25
22
19
32
1.97
6105331--6105519
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2.8
68
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1
263
25
22
21
29
1.99
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45
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7
238
22
19
22
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3.4
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288
22
21
20
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1.96
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1.9
66
96
0
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35
11
19
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1.88
6107169--6107214
1
46.0
1
82
0
56
0
0
8
91
0.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6110022--6110068
19
2.5
20
89
6
71
42
8
21
27
1.81
6112763--6112853
3
30.3
3
73
20
68
65
1
3
29
1.15
6112768--6112852
18
4.7
18
79
13
77
65
1
3
29
1.16
6112763--6112849
27
3.4
27
71
19
78
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1
3
29
1.16
6113147--6113198
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2.0
26
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10
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51
26
1
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1.57
6113175--6113269
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4.4
22
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7
86
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1
10
1.40
6124841--6124905
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2.0
32
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9
3
29
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1.44
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52
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11
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30
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1.97
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2.5
20
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38
0
4
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15
3.4
15
73
21
50
33
10
0
56
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444