Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  425  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122832867--122833031
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50
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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23
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60
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2.4
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2.2
26
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122928493--122928669
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23
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25
85
0
68
42
7
9
40
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
33
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1.91
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25
2.2
25
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20
20
14
44
1.86
122945167--122945219
24
2.2
24
83
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63
11
24
28
35
1.90
122951894--122951923
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2.4
12
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51
50
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6
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1.45
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2.0
26
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2
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1.32
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0
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0
64
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123011670--123011728
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5
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10
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123014128--123014166
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4
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12
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15
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6.2
6
96
3
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0
16
0
0.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.9
17
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28
6
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1.79
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32
14
19
33
1.92
123030182--123030633
151
3.0
150
86
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626
32
14
19
33
1.92
123030617--123030675
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2.3
26
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1.9
184
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1.9
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88
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2.7
239
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1.92
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3.4
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15
21
26
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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100
43
7
16
32
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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2.2
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0
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2.3
17
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53
71
0
10
17
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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