Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  40  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9816652--9816758
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2.3
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2
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
A
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62
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9937225--9937272
15
3.3
15
82
2
53
47
2
8
41
1.45
9937376--9937424
25
1.9
26
84
12
66
40
6
10
42
1.63
9938921--9938967
24
2.0
23
87
4
67
25
6
4
63
1.36
9938962--9938992
15
2.1
14
94
5
53
0
12
3
83
0.75
9939640--9939776
21
6.4
21
75
10
98
27
5
4
63
1.34
9939711--9939796
27
3.2
27
76
3
66
31
6
2
59
1.37
9939624--9939776
3
52.0
3
68
5
80
27
6
3
62
1.38
9939995--9940038
18
2.4
18
85
14
72
27
4
0
68
1.09
9940456--9940636
25
7.2
25
90
6
294
33
7
22
36
1.83
9940456--9940636
51
3.6
51
93
3
305
33
7
22
36
1.83
9942133--9942185
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
9947568--9947753
26
7.2
26
91
0
300
33
8
23
35
1.84
9949237--9949288
25
2.0
26
85
10
72
38
23
13
25
1.91
9962121--9962163
23
1.9
22
85
4
59
60
0
18
20
1.36
9963265--9963315
26
2.0
26
85
11
70
52
9
7
29
1.62
9963666--9963720
28
1.9
29
85
3
76
47
0
3
49
1.19
9965474--9965532
20
2.9
21
82
5
66
59
5
0
35
1.20
9965477--9965531
18
2.9
19
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10
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60
5
0
34
1.20
9965509--9965560
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2.0
26
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0
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50
3
1
44
1.31
9970910--9970965
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2.7
21
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0
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26
1
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1.35
9972747--9972962
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27
12
0
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9978272--9978306
18
1.9
18
88
0
52
65
5
5
22
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9985492--9985538
22
2.2
22
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69
38
6
8
46
1.60
9985997--9986035
17
2.3
17
86
0
51
38
10
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43
1.67
9988798--9988858
18
3.3
18
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11
52
65
1
6
26
1.26
9989337--9989371
17
2.1
17
89
10
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37
5
0
57
1.23
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0
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54
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0
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0
3
15
0.85
9999790--9999862
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11
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0
4
19
0.94
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40
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0
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1.90
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1.50
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1
0
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1.05
10011873--10011923
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1
0
33
1.05
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20
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1.8
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96
0
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29
21
20
1.98
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46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10034552--10034723
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93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
10034545--10034720
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
10038210--10038251
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2.3
18
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16
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65
64
0
0
35
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444