Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  79  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18640602--18640719
47
2.5
47
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6
141
19
18
21
40
1.91
18640707--18640749
6
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6
97
0
77
16
18
16
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1.81
18640859--18640932
18
4.1
18
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10
69
31
9
14
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18640949--18640996
18
2.7
18
80
0
60
37
10
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39
1.77
18640939--18641012
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2.1
36
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0
85
41
10
10
36
1.75
18655616--18655783
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0
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38
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5
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62
1.26
18661750--18661807
14
4.4
14
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18
52
29
3
0
67
1.07
18661762--18661812
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2.0
26
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7
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5
0
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39
5.4
40
89
3
324
23
22
27
26
1.99
18664044--18664255
79
2.7
79
92
2
338
23
22
27
26
1.99
18671900--18672121
40
5.6
40
90
1
331
23
22
26
27
2.00
18675083--18675120
17
2.5
15
80
19
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39
10
15
34
1.82
18675089--18675196
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22
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13
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1.82
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40
2.3
40
87
0
134
39
22
20
18
1.92
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7
9.9
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15
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64
3
0
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1.11
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15
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2
0
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0.96
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22
2.5
22
84
0
72
68
1
0
29
1.00
18684570--18684674
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1.9
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122
40
3
2
52
1.34
18684754--18684987
43
5.5
43
83
3
276
24
17
27
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18685336--18685409
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2.0
37
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2
141
24
9
29
36
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18686334--18686672
169
2.0
169
91
0
543
35
12
24
26
1.92
18692517--18692546
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2.1
14
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0
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16
1.47
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14
2.1
14
93
0
51
46
36
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16
1.47
18703953--18703978
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4.3
6
100
0
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15
19
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34
1.93
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41
0
0
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0.98
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59
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1
0
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1.10
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27
29
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1.81
18713771--18713842
26
2.7
25
75
10
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45
2
11
40
1.54
18713717--18713950
97
2.5
95
76
6
242
39
1
14
44
1.55
18714027--18714067
13
3.2
13
74
19
50
48
0
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1.30
18719612--18719661
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2.0
25
100
0
100
24
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12
32
1.91
18731542--18731587
2
23.0
2
90
0
74
50
0
2
47
1.13
18731942--18732027
3
28.3
3
72
17
63
63
1
4
30
1.21
18731942--18732024
12
6.8
12
76
11
71
63
1
4
30
1.22
18731942--18732028
27
3.4
27
70
13
76
64
1
4
29
1.21
18733536--18733583
19
2.4
19
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6
60
62
4
4
29
1.32
18733550--18733586
19
1.9
19
100
0
74
62
0
5
32
1.18
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309
1.8
303
81
9
700
44
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11
35
1.72
18739669--18739706
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
18740575--18740604
2
15.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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44
28.9
44
90
3
1864
22
32
17
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18741215--18742464
171
7.2
173
88
4
1769
22
32
17
28
1.96
18742702--18742824
61
2.0
64
87
7
182
38
11
16
34
1.84
18754148--18754323
46
3.8
46
79
12
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20
21
29
28
1.98
18754145--18754316
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1.8
93
96
0
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20
21
29
27
1.98
18761730--18761905
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3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
18761727--18761898
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
18766716--18766968
134
1.9
133
96
0
470
19
10
18
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1.74
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21
1.9
21
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30
10
12
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1.74
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24
2.8
24
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8
102
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19
7
47
1.75
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9
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9
132
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0
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20
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20
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0
124
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21
32
1.89
18783438--18783492
11
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11
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16
55
36
12
20
30
1.90
18783542--18783708
24
7.0
24
85
7
225
27
23
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18783542--18783708
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3.5
47
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3
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27
23
21
26
1.99
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21
2.4
21
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0
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29
19
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1
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0
80
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4
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5
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18792838--18792898
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1
0
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0.92
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1.00
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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2.3
20
85
7
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77
2
6
14
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18824413--18824461
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2
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23
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2.0
252
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11
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4
3
75
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18864321--18864504
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0
0
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534
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1598
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10
13
43
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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