Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  327  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94381548--94381584
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1.9
19
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0
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2.0
468
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55
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0
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30
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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383
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21
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21
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31
1.94
94431150--94431589
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4.9
89
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302
32
21
14
32
1.93
94430824--94431589
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415
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21
15
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1.94
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2.0
22
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17
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57
2
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28
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29
80
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17
10
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94461869--94461947
15
5.4
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77
10
83
58
13
17
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1.63
94461880--94461956
15
5.2
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77
55
15
16
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94464902--94465073
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
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225
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28
21
21
1.98
94467432--94467588
68
2.3
68
82
3
183
25
13
18
42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94470844--94470906
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2.3
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36
1.83
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58
2.9
58
90
0
259
21
19
30
27
1.98
94471081--94471181
29
3.5
29
69
15
91
22
19
27
29
1.98
94471103--94471246
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5.0
28
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114
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19
31
27
1.98
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3.4
28
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81
20
19
34
25
1.96
94473571--94473727
68
2.3
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192
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14
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1.88
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17
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1.89
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2.0
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1.87
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16
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32
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0
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2.0
13
100
0
52
46
0
7
46
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
0
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0
0
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1
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24
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0
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2
2
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2.0
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30
5
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60
1.34
94516818--94516861
20
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19
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0
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2.7
18
80
9
53
76
0
4
19
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
2.3
25
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61
5
5
28
1.39
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24
2.0
25
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1.40
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6
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19
1.82
94590954--94591047
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18
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16
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13
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19
1.82
94590969--94591047
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2.5
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0
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18
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1.98
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1.98
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27
16
28
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94624443--94624511
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2.3
30
100
0
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10
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0
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0
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127
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6
355
28
19
19
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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