Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  441  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
127980659--127980898
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1.8
132
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1
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0
32
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1.18
127981614--127981706
42
2.2
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12
100
65
1
4
29
1.18
127982017--127982118
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115
63
31
0
4
1.15
127982041--127982118
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0
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0
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0
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18
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1
2
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2
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1.10
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2.9
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0
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0
0
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0.99
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1.9
34
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2.0
89
96
0
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20
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1.95
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2.1
55
100
0
226
20
25
12
41
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
23
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0
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0
9
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13
3.7
13
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62
68
0
6
25
1.12
128032250--128032780
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5.1
105
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5
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37
14
13
34
1.85
128032606--128032630
12
2.1
12
100
0
50
24
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0
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90
90
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63
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2.0
57
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2.0
21
90
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19
29
21
29
1.98
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17
2.2
17
100
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24
16
24
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31
1.9
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6
86
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13
26
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19
1.9
19
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21
10
10
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11
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70
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4
21
1.21
128062675--128062716
20
2.2
19
87
12
59
78
0
2
19
0.86
128062675--128062716
5
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5
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12
52
78
0
2
19
0.86
128062675--128062732
29
2.0
30
90
6
93
75
0
5
18
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53
67
0
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1.16
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3
73
10
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2
6
28
1.31
128062998--128063134
32
4.2
31
73
18
98
62
2
5
29
1.30
128062998--128063134
41
3.3
41
73
14
113
62
2
5
29
1.30
128066966--128067006
14
3.0
14
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0
0
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0
0
100
0.00
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20
81
11
58
35
0
6
57
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128074454--128074483
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2.0
15
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0
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26
1.53
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14
2.0
15
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51
31
0
20
48
1.50
128091062--128091128
31
2.2
30
86
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98
32
4
8
53
1.52
128091070--128091131
31
2.0
31
96
0
115
33
3
8
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1.46
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45
3.5
44
70
15
131
27
16
26
28
1.97
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20
2.4
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68
6
2
22
1.23
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2.1
16
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50
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35
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1
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1.61
128109981--128110051
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43
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1
26
1.63
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14
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20
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1
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29
29
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19
1.98
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20
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0
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14
0
20
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1.28
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9
91
0
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24
12
24
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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0
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0
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47
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2.0
21
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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228
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227
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1.99
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2.0
456
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1
1149
28
26
24
19
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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51
0
2
45
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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