Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
205
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
80
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2
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30
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22
1.99
84003861--84003968
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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29
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1.99
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24
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25
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7
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1.95
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0
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23
2.00
84024728--84024952
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25
28
23
23
2.00
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27
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1.81
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1.83
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2.00
84043765--84043859
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1.9
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2.00
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1.84
84046359--84046557
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54
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1.84
84046377--84046557
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1.84
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4.3
54
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3
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19
9
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1.83
84046589--84046793
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29
1.82
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2.5
81
81
4
241
41
19
8
29
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84046589--84046794
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2.00
84047778--84047872
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84069102--84069214
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1.95
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1.9
25
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25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84101892--84102043
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24
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21
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84101892--84102043
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2.1
71
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21
21
28
1.99
84101892--84102043
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21
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1.99
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20
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22
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20
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0
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20
11
35
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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