Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  323  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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2.0
56
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206
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40
2.0
40
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131
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18
29
30
1.97
93152471--93152554
40
2.1
40
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0
105
25
21
27
26
1.99
93152380--93152554
96
1.8
96
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28
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31
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56
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28
2.4
28
80
11
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55
2
1
39
1.24
93171880--93171949
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3.7
20
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2
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40
1.23
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20
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17
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11
50
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31
0
25
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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15
25
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13
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0
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1
15
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93223566--93223624
18
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16
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15
66
76
6
1
15
1.07
93223566--93223624
5
10.6
5
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20
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76
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26
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2.0
30
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28
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22
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2.1
42
95
0
160
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14
5
28
1.65
93252111--93252150
19
2.2
18
95
4
71
42
17
0
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1.49
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1.9
17
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70
14
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1.9
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107
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186
2.9
185
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769
25
24
8
41
1.84
93259993--93260021
14
2.0
15
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6
51
55
0
44
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0.99
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2.2
26
81
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62
70
0
5
24
1.08
93269113--93269157
18
2.5
19
82
10
58
46
0
2
51
1.13
93276190--93276227
20
2.0
20
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60
39
2
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44
1.57
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15
4.4
16
82
10
74
58
0
5
35
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93276397--93276471
28
2.5
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16
79
58
0
5
36
1.21
93276396--93276470
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79
15
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58
0
5
36
1.21
93276473--93276514
18
2.3
19
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21
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1.26
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20
2.0
20
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39
2
13
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17
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60
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8
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17
68
59
0
4
35
1.18
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14
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58
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1.16
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18
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0
10
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1.23
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1.9
18
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9
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1.62
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23
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24
1.97
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1.8
94
87
2
256
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17
27
24
1.97
93311589--93311798
94
2.2
94
82
5
246
30
17
28
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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16
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3
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0
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0
0
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6
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1.01
93318008--93318098
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1.00
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22
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0
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27
29
29
12
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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106
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28
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48
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206
33
28
18
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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100
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26
15
16
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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