Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  29  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7251962--7252089
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79
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46
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1
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1.59
7252637--7252684
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0
0
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0
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0
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10
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2.4
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0
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111
36
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19
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18
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18
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0
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10
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1.84
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2.5
18
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20
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1.88
7275637--7275696
18
3.3
18
76
0
66
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0
0
50
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7278304--7278668
92
4.0
92
89
1
525
21
25
13
40
1.90
7281089--7281157
30
2.3
30
80
5
77
30
17
2
49
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7285643--7285705
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2.0
32
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1
1
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7285966--7285997
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
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7286121--7286151
15
2.1
15
100
0
62
48
0
6
45
1.28
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19
2.0
19
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10
51
52
5
10
31
1.58
7287267--7287303
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2.1
19
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51
0
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1.32
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28
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28
18
26
26
1.98
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19
2.1
19
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10
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51
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0
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25
20
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1.99
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2.1
19
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51
0
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1.32
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460
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2.3
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26
19
26
26
1.99
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2.0
14
100
0
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1.73
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55
2.1
56
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135
35
21
23
20
1.96
7309084--7309171
27
3.1
27
85
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115
32
22
23
20
1.98
7315292--7315319
14
2.0
14
100
0
56
42
7
14
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1.73
7316643--7316736
29
3.2
29
76
4
100
58
1
2
38
1.17
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30
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29
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8
110
59
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1
37
1.15
7316677--7316717
21
2.0
21
85
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55
53
2
4
39
1.35
7318966--7319118
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2.1
73
82
4
184
19
25
20
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1.96
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15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
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2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7323594--7323624
14
2.2
14
100
0
62
51
12
12
22
1.74
7323734--7323815
27
2.7
31
72
27
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57
8
1
32
1.37
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22
2.0
23
86
13
65
60
4
0
34
1.17
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22
2.2
25
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10
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51
5
3
38
1.44
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
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2.4
24
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56
7
3
33
1.43
7324347--7324530
3
59.7
3
72
14
101
60
5
2
30
1.32
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87
3.4
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14
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1.91
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1.15
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5.4
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79
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492
34
21
16
28
1.95
7326103--7326406
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3.5
88
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11
286
36
20
14
29
1.92
7326336--7326942
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8.2
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6
792
33
21
16
28
1.95
7326341--7326930
226
2.6
225
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965
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22
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25
20
15
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
0
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0
0
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10.0
5
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58
0
0
42
0.98
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9
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0
0
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5
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0
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0
0
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10
10
0
79
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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26
11
27
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
0
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9
32
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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