Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  248  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70518483--70518528
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
70525507--70525673
40
4.2
40
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2
185
25
27
21
25
1.99
70525507--70525673
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
70526499--70526544
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
70527371--70528713
48
28.0
48
89
0
2017
31
27
6
34
1.82
70527371--70528703
96
13.9
96
96
0
2407
31
27
6
34
1.82
70542078--70542106
13
2.1
14
93
6
51
24
37
24
13
1.91
70543864--70543978
24
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21
1.94
70543961--70544034
29
2.6
29
97
0
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28
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14
24
1.95
70566583--70566804
78
2.8
80
83
9
267
26
22
26
25
2.00
70566583--70566806
40
5.7
40
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6
264
26
21
26
25
2.00
70574580--70574802
79
2.8
80
83
8
267
26
21
26
25
2.00
70574580--70574804
40
5.7
40
88
5
264
26
21
26
25
2.00
70574580--70574811
119
1.9
119
80
9
267
26
21
26
25
2.00
70576516--70576560
23
1.9
24
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4
56
57
11
11
20
1.63
70578255--70578288
18
2.0
18
88
11
54
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23
17
1.90
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29
2.4
29
100
0
142
29
15
28
26
1.96
70582178--70582308
29
4.5
29
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3
106
26
16
31
25
1.97
70584526--70584655
29
4.6
28
75
11
106
23
30
16
30
1.96
70584740--70584785
19
2.5
19
85
3
58
21
39
17
21
1.93
70592300--70592357
28
2.1
28
80
6
64
24
32
13
29
1.94
70592312--70592458
29
5.2
29
76
8
133
25
30
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70592525--70592571
19
2.5
19
86
3
60
21
36
17
25
1.94
70596146--70596185
21
2.0
21
90
5
64
10
32
30
27
1.89
70603707--70603880
75
2.3
75
89
3
253
22
33
21
22
1.97
70605523--70605701
59
3.0
59
89
3
279
30
30
17
21
1.96
70609791--70609891
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
70621373--70621401
13
2.1
14
93
6
51
24
37
24
13
1.91
70638293--70638422
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
70646219--70646348
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
70648742--70648810
34
2.0
34
83
5
86
24
27
20
27
1.99
70649965--70650010
23
1.9
25
82
8
60
54
10
10
23
1.67
70651713--70651746
18
2.0
18
88
11
54
41
17
23
17
1.90
70654908--70655035
29
4.5
29
79
10
124
23
31
14
30
1.95
70654908--70655054
57
2.6
57
78
9
140
26
29
14
29
1.95
70655122--70655167
19
2.5
19
85
3
58
21
39
17
21
1.93
70664723--70664762
21
2.0
21
95
5
73
10
35
30
25
1.88
70665631--70665670
21
1.9
21
84
0
53
27
15
5
52
1.63
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40
3.7
40
84
7
181
24
21
26
26
2.00
70675274--70675523
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
70679266--70679422
40
3.9
39
78
10
140
26
21
24
27
1.99
70687736--70687864
49
2.6
50
81
3
163
24
27
19
28
1.98
70687884--70688059
46
3.8
46
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142
28
26
14
29
1.95
70692188--70692227
15
2.7
15
88
3
55
45
30
2
22
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70692340--70692412
7
10.6
7
78
8
51
31
21
1
45
1.61
70692364--70692405
21
2.0
21
90
9
68
33
14
0
52
1.42
70692366--70692413
21
2.3
20
85
7
60
33
18
0
47
1.49
70692364--70692405
14
3.1
13
89
6
57
33
14
0
52
1.42
70694111--70694234
63
2.0
63
80
3
142
34
29
4
31
1.76
70698808--70698910
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
70714826--70714928
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
70722892--70722962
29
2.4
29
86
4
90
26
15
30
26
1.96
70736511--70736708
27
7.3
27
85
4
238
27
24
9
38
1.85
70736511--70736708
81
2.4
81
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3
283
27
24
9
38
1.85
70736707--70736863
27
5.8
27
83
0
206
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19
9
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1.84
70736707--70736866
54
3.0
54
91
0
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38
20
10
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1.85
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19.6
27
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34
20
20
24
1.96
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54
85
1
603
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20
19
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1.96
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15
16
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19
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15
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1.79
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2.5
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15
15
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0
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26
26
26
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20
20
1.91
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67
2.2
67
81
8
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21
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70748852--70749031
67
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17
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23
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2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
25
2.00
70754478--70754663
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25
2.00
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40
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24
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1.99
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30
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14
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3
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4
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39
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
13
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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19
30
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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