Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  383  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111024382--111024504
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19
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1.15
111024428--111024513
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2
3
30
1.23
111024408--111024551
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11
147
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1.33
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19
4.4
19
78
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33
3
0
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2.4
57
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9
158
31
2
1
63
1.18
111024705--111024838
19
7.0
19
68
19
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30
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1
64
1.17
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2.4
16
90
0
58
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2
2
7
0.74
111033746--111033791
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2.0
23
86
4
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26
2.2
26
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69
35
3
3
57
1.34
111035216--111035254
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3.2
12
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5.7
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76
18
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161
2.9
160
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587
26
18
22
32
1.97
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2.0
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14
2.1
14
100
0
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13
13
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1.8
176
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19
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1.93
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3.9
88
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378
26
17
19
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2.8
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0
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0
0
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92
0
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0
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50
1.18
111050666--111050704
12
3.2
12
92
7
62
33
5
7
53
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111058573--111058628
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3.4
18
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61
25
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19
1.74
111058563--111058646
30
2.8
30
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0
150
27
50
5
16
1.68
111059140--111059191
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2.2
23
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36
3
0
59
1.16
111059207--111059320
25
4.5
26
75
13
96
35
6
4
54
1.45
111059236--111059310
27
2.7
29
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23
72
34
5
4
56
1.41
111059335--111059393
23
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55
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111059514--111059548
16
2.3
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2
2
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2.0
111
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8
7
42
1.62
111066687--111066737
22
2.3
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12
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27
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11
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5.2
26
90
1
220
33
5
25
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1.78
111073649--111073692
14
2.8
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10
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31
0
4
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1.14
111083268--111083384
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2.3
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93
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198
32
15
24
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1.95
111085487--111085531
17
2.3
21
75
21
53
48
2
0
48
1.13
111092858--111092917
15
4.0
15
75
0
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41
28
6
23
1.79
111092865--111092927
30
2.1
30
85
5
83
47
28
4
19
1.69
111093279--111093304
6
4.3
6
100
0
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34
34
15
15
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18
3.0
18
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19
51
50
19
7
23
1.72
111093327--111093394
20
3.5
21
69
17
65
52
22
5
19
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111093306--111093397
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2.4
38
96
0
166
48
21
7
21
1.74
111095080--111095126
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2.0
23
84
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60
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0
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54
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5
0
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1.19
111103268--111103292
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111106114--111106160
20
2.3
22
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46
1.62
111107075--111107110
14
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4
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0
0
27
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19
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0
30
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44
0
0
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3.1
15
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58
42
0
0
57
0.98
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2.0
22
82
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44
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0
53
1.13
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2.1
61
96
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0
0
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0
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0
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1.63
111145126--111145194
5
13.6
5
80
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70
78
2
0
18
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111145129--111145193
7
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80
16
55
80
3
0
16
0.85
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5
10.6
5
84
7
65
79
1
0
18
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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77
1
0
20
0.86
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6.5
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0
0
17
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3.2
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82
0
0
17
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1.9
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38
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45
1.63
111155064--111155163
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2.2
45
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0
137
49
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8
38
1.54
111155124--111155198
35
2.2
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49
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38
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1.8
108
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0
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2.1
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23
0
4
72
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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3
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1.35
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3.2
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36
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0
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0
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20
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2.0
21
100
0
86
32
0
23
44
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111234543--111234657
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44
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1.67
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3.1
40
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20
34
1.68
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10.8
13
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2
18
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1.64
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0
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0
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3.9
8
100
0
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25
48
0
25
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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