Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  435  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125914416--125914447
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0
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0
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2.4
36
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120
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2.0
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0
2
46
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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148
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1
0
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3
0
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1.14
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4.0
210
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8
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89
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10
0
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22
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1
0
61
1.06
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3.1
11
88
12
52
44
0
8
47
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126036058--126036136
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31
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6.0
6
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2.0
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0
0
0.00
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10
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1.57
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44
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3
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13
33
1.93
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2.4
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3
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23
13
33
1.93
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2.0
84
90
1
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43
8
14
33
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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23
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1
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1.20
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2.9
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31
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19
1.96
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30
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25
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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22
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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45
10
8
35
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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