Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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1.52
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1.9
18
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0
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1
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3.3
21
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70
34
4
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55
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10920474--10920512
18
2.1
19
85
9
53
33
0
7
58
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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4
4
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10922528--10922572
23
2.0
23
95
0
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4
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26
1.72
10928772--10928846
15
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15
83
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80
41
4
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33
1.72
10931083--10931215
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2.0
52
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24
27
1.93
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
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32
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2.0
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50
16
5
27
1.66
10946661--10946700
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2.7
15
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0
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18
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0
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25
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17
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1.40
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19
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25
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6
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22
2.4
23
85
8
78
37
0
5
57
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10972953--10972977
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0
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0
0
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0.99
10972921--10973006
40
2.1
39
83
8
109
43
0
0
56
0.99
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1
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1.18
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107
35
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2
62
1.10
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15
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
0
38
38
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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