Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr10 129486693 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  129486693

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   

This is table  31  of  444  ( 53255 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7674022--7674053
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0
0
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0
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0
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1.00
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4
0
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1.20
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2.1
21
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0
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40
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0
53
1.27
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3
400
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2.2
26
90
0
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20
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2.6
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185
17
22
22
37
1.94
7679427--7679566
27
5.2
28
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7
148
17
22
22
37
1.94
7679628--7679667
19
2.0
22
85
14
59
17
2
47
32
1.61
7682376--7682472
32
3.0
32
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5
160
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21
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3.9
44
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0
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29
29
17
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3.1
73
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3
261
34
18
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30
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160
3.1
160
95
0
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15
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1.93
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2.0
87
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20
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4.0
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256
35
21
14
28
1.93
7683947--7684124
87
2.0
87
82
4
216
39
20
13
26
1.89
7684107--7684269
87
1.9
87
87
2
238
38
21
14
26
1.91
7685030--7685145
42
2.8
41
84
10
137
14
25
16
43
1.85
7685065--7685145
42
2.0
41
95
2
144
17
27
16
39
1.90
7696287--7696332
23
1.9
25
86
8
69
52
4
4
39
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7696659--7696710
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2.1
26
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53
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1
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1.41
7696791--7696884
42
2.3
40
80
8
107
32
20
23
23
1.97
7696812--7696926
42
2.8
42
88
2
171
32
21
20
25
1.98
7697575--7697614
21
1.9
21
84
0
53
22
0
25
52
1.47
7697659--7697697
18
2.2
18
95
0
69
33
0
15
51
1.44
7697773--7697862
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2.4
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2
27
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1.66
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64
2.1
64
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209
38
10
3
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3.0
24
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21
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2.7
241
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0
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15
34
1.91
7707769--7707858
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2.1
43
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4
110
24
24
23
27
2.00
7707791--7707880
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2.1
43
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0
117
23
27
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1.98
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23
2.4
22
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12
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66
3
1
28
1.20
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30
2.9
30
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147
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15
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3
1.09
7709930--7710006
18
4.6
18
79
14
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72
20
2
3
1.12
7709930--7709986
31
1.9
30
92
7
98
77
15
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3
1.05
7721052--7721241
72
2.6
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254
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15
23
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1.94
7721259--7721692
72
6.0
72
86
4
532
30
16
18
33
1.94
7720883--7721659
199
3.9
196
81
8
763
28
15
20
35
1.93
7721606--7721785
93
2.0
91
86
2
252
26
19
18
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1.95
7721260--7722304
142
6.9
157
80
10
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29
17
19
34
1.94
7721720--7722277
72
7.5
72
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598
29
17
20
33
1.95
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214
2.0
207
83
5
484
30
17
19
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7723144--7723198
29
2.0
28
92
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94
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16
3
3
1.07
7723171--7723221
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2.7
19
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2.0
20
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2
23
1.28
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2.1
29
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9
70
32
4
3
59
1.35
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22
2.2
23
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46
0
0
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2.4
24
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12
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1.54
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22
2.9
24
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54
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1
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1.9
28
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1
3
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1.18
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13.3
3
83
0
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70
0
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15
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0
2
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1.19
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3.2
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17
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18
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62
67
2
4
26
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7748544--7748605
3
20.7
3
100
0
124
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0
0
33
0.92
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28
3.7
27
71
18
72
27
26
19
26
1.99
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60
2.2
59
83
8
157
26
26
20
26
1.99
7762083--7762121
19
2.2
19
86
9
55
74
0
15
10
1.07
7774075--7774177
50
2.1
50
100
0
206
37
15
15
31
1.89
7777847--7777982
26
5.2
26
93
0
227
33
5
24
36
1.78
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27
5.2
27
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4
174
17
23
23
35
1.96
7779607--7779745
54
2.6
54
88
3
192
17
23
23
35
1.96
7780960--7781007
10
4.8
10
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10
62
66
2
8
22
1.29
7780958--7781017
20
3.0
19
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9
75
66
1
8
23
1.28
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11
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0
0
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5
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0
0
20
0.73
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29
2.9
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133
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0
1
21
0.83
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131
2.6
130
93
2
559
27
16
20
35
1.94
7796876--7796932
21
2.6
21
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5
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35
24
26
14
1.93
7797319--7797376
15
3.8
15
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2
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12
0
36
1.39
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0
0
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0
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0
0
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5
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7
57
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0
0
18
0.70
7802660--7802690
9
3.3
9
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80
0
0
19
0.71
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19
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45
0
0
54
0.99
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62
2.0
62
88
3
185
34
21
21
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7811525--7811564
14
2.9
15
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14
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0
12
1.42
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4.1
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0
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0
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0
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1.00
7812590--7812642
20
2.8
17
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11
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37
3
1
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1.28
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22
3.6
22
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19
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28
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6
60
1.41
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2.6
21
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1.44
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24
3.9
24
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1.95
7816630--7816715
24
3.6
24
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0
109
25
15
26
32
1.95
7826159--7826236
40
2.0
39
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2
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19
14
1.74
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205
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1.95
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15
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0
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0
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0
50
1.00
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1.28
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22
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28
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60
1.41
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22
2.0
22
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0
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1.53
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2.1
22
84
0
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1.45
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19
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26
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1.42
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1.45
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4
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4
12
80
0.99
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77
2.9
74
87
4
286
34
20
15
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7837801--7837875
38
2.0
38
100
0
150
44
10
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29
1.81
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110
1.9
108
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1
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15
31
1.91
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180
2.0
185
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34
18
16
29
1.93
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10.2
72
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19
16
30
1.93
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148
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502
33
19
16
30
1.94
7837847--7838612
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5.0
154
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14
491
33
19
16
30
1.93
7837919--7838616
310
2.3
306
82
7
853
34
19
15
30
1.93
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0
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0
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16
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1.89
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3.5
71
82
5
270
30
21
16
32
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444