Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  10  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2702714--2702749
10
3.8
10
85
14
58
44
0
11
44
1.39
2702708--2702749
18
2.3
18
100
0
84
45
0
9
45
1.36
2707979--2708020
21
2.0
21
86
9
59
59
4
2
33
1.31
2716691--2716729
18
2.3
18
86
8
55
35
20
0
43
1.52
2716709--2716756
20
2.2
20
82
10
51
31
12
0
56
1.37
2717149--2717179
15
2.1
15
93
0
53
45
3
0
51
1.17
2717436--2717481
6
7.5
6
87
2
65
34
28
15
21
1.94
2720294--2720519
85
2.6
85
85
4
292
41
20
15
22
1.90
2720505--2720553
12
4.3
12
80
10
50
75
2
0
22
0.90
2722749--2722782
16
2.1
17
88
5
52
55
2
0
41
1.15
2723948--2724025
29
2.7
29
78
7
86
50
1
0
48
1.09
2730155--2730194
17
2.4
17
100
0
80
35
0
40
25
1.56
2733891--2733934
19
2.2
20
92
4
72
50
0
0
50
1.00
2734111--2734154
16
2.7
16
86
10
54
45
2
0
52
1.13
2737294--2737349
25
2.2
26
78
18
64
46
1
3
48
1.30
2738623--2738662
17
2.3
18
86
4
55
70
0
7
22
1.12
2740320--2740893
6
95.8
6
73
17
256
32
2
3
62
1.24
2740312--2740370
9
6.3
9
76
11
57
38
5
0
55
1.22
2740318--2740979
18
37.8
17
70
18
145
32
2
3
61
1.26
2740320--2740754
190
2.3
186
90
5
655
32
2
3
61
1.26
2740498--2741042
167
3.2
168
94
1
941
31
2
4
62
1.26
2740320--2740983
357
1.8
357
86
6
948
32
2
3
61
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2744825--2744855
8
3.9
8
95
0
53
22
35
3
38
1.71
2750950--2751062
39
2.9
39
97
0
208
36
19
12
31
1.89
2753214--2753514
77
3.9
78
81
3
367
31
15
20
32
1.94
2753214--2753482
76
3.5
77
81
4
265
32
16
20
30
1.95
2753449--2753568
64
1.9
64
91
0
195
25
17
25
32
1.97
2753881--2753942
26
2.4
26
91
0
97
19
25
14
40
1.90
2753975--2754085
45
2.5
45
79
7
111
28
20
23
27
1.99
2755495--2755732
3
79.7
3
73
17
160
31
2
2
62
1.25
2755538--2755889
155
2.3
155
93
1
589
31
3
4
60
1.33
2755762--2755798
18
2.0
20
84
10
51
40
0
5
54
1.24
2756930--2756968
16
2.4
16
91
0
60
69
0
30
0
0.89
2759049--2759278
46
5.0
46
94
0
370
39
15
23
21
1.91
2759064--2759326
92
2.8
90
86
4
276
40
15
23
20
1.90
2764000--2764083
28
3.0
28
87
1
123
19
3
29
47
1.66
2767711--2767747
15
2.4
16
86
4
58
59
0
0
40
0.97
2768555--2768695
73
1.9
74
85
4
196
38
3
5
52
1.42
2776743--2776794
20
2.6
20
78
0
59
34
15
11
38
1.83
2780796--2781053
47
5.5
47
87
3
297
31
28
15
23
1.96
2785175--2785227
8
7.0
8
79
16
51
28
0
1
69
0.99
2785177--2785227
7
6.9
7
77
18
50
27
0
1
70
0.98
2785177--2785227
13
3.4
15
81
15
61
27
0
1
70
0.98
2785453--2785501
23
2.1
24
85
11
66
63
0
4
32
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2791932--2791956
11
2.3
11
100
0
50
24
0
8
68
1.16
2809963--2810010
24
2.0
23
96
4
87
72
0
4
22
1.01
2809963--2810010
11
4.2
12
80
15
57
72
0
4
22
1.01
2812587--2812923
35
9.6
35
88
0
415
30
13
25
30
1.94
2813019--2813110
31
3.0
31
91
3
141
21
18
31
28
1.97
2816120--2816179
24
2.5
25
78
13
72
35
15
28
21
1.93
2816654--2816694
21
2.0
21
85
0
55
43
19
2
34
1.64
2830036--2830085
19
2.5
20
81
15
59
28
0
16
56
1.41
2852506--2852791
93
3.1
89
80
6
277
36
17
11
34
1.87
2853202--2853294
47
2.0
47
100
0
186
49
4
15
31
1.63
2855533--2855585
18
2.8
19
78
16
56
28
9
0
62
1.26
2857421--2857736
89
3.6
86
82
7
338
35
8
17
38
1.80
2858250--2858293
19
2.2
20
92
4
72
36
22
13
27
1.92
2858261--2858412
19
7.9
19
69
2
70
46
21
7
24
1.76
2860386--2860439
22
2.5
22
93
0
90
25
35
20
18
1.95
2860518--2860570
26
2.0
26
82
7
63
28
11
20
39
1.87
2862057--2862164
26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
2864286--2864338
3
17.7
3
77
14
56
37
0
0
62
0.96
2864285--2864329
17
2.7
17
96
3
83
40
0
0
60
0.97
2864364--2864396
16
2.1
16
94
0
57
75
6
15
3
1.11
2864416--2864445
14
2.1
15
93
6
53
73
0
23
3
0.98
2867882--2867924
19
2.4
19
85
11
56
25
25
2
46
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2867882--2867925
18
2.6
16
82
13
52
27
25
2
45
1.65
2868429--2868459
5
6.2
5
100
0
62
22
19
19
38
1.93
2870193--2870261
29
2.3
30
78
11
79
49
2
0
47
1.16
2870194--2870258
30
2.2
30
86
5
87
49
3
0
47
1.17
2873647--2873681
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
2878902--2878945
7
5.9
7
80
15
52
86
2
2
9
0.75
2878902--2878954
15
3.5
15
89
7
72
84
3
1
9
0.81
2878902--2878953
8
6.6
8
80
12
63
86
3
1
7
0.76
2879865--2879891
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
2880253--2880301
18
2.5
19
81
18
57
40
4
0
55
1.19
2880260--2880423
58
2.8
59
78
10
151
34
3
7
54
1.43
2881256--2881291
2
18.0
2
94
0
63
47
0
2
50
1.15
2884045--2884088
3
14.3
3
84
13
54
29
2
0
68
1.02
2884045--2884096
14
3.8
13
82
14
61
28
1
0
69
0.99
2884307--2884341
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
2895096--2895179
39
2.2
39
100
0
168
27
27
23
21
1.99
2908451--2908488
19
2.0
19
85
10
51
50
5
7
36
1.54
2909511--2909563
17
2.9
18
86
8
81
35
15
11
37
1.83
2910114--2910310
45
4.4
45
83
3
236
26
27
13
31
1.94
2910128--2910297
89
1.9
89
87
0
250
28
28
13
29
1.94
2910327--2910620
78
3.8
77
90
4
464
25
23
18
32
1.97
2911329--2911360
12
2.7
12
95
0
55
34
25
3
37
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2919443--2919501
21
2.9
21
79
18
63
42
16
6
33
1.75
2919480--2919571
36
2.5
37
87
10
136
34
14
11
39
1.82
2919481--2919571
19
4.9
19
88
6
143
35
14
12
38
1.83
2919690--2919730
21
2.0
21
85
0
55
9
2
14
73
1.19
2929652--2929694
3
13.7
3
85
9
59
0
2
30
67
1.03
2929970--2930048
41
1.9
41
81
0
95
49
8
8
32
1.65
2931984--2932008
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
2932464--2932507
17
2.6
16
78
21
54
25
25
4
45
1.72
2936816--2936890
38
2.0
38
86
0
105
34
9
21
34
1.85
2938314--2938356
19
2.3
19
91
0
68
41
4
11
41
1.62
2940074--2940162
45
2.0
45
86
4
126
40
11
19
29
1.86
2940123--2940275
31
4.9
31
76
3
148
40
15
15
29
1.87
2940122--2940275
62
2.5
62
86
2
220
40
14
14
29
1.87
2948439--2948499
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
2948592--2948801
3
69.7
3
75
10
151
57
2
7
33
1.39
2948866--2948907
16
2.7
15
85
7
57
64
0
7
28
1.20
2949006--2949038
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
2949133--2949165
3
10.7
3
93
6
57
63
0
0
36
0.95
2949168--2949193
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
2949665--2949725
27
2.3
27
91
0
95
54
18
3
24
1.58
2950146--2950178
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
2951765--2951795
10
3.1
10
100
0
62
12
29
0
58
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2954006--2954224
46
4.9
46
84
9
276
21
24
15
39
1.91
2954138--2954213
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
2954257--2954397
54
2.6
54
100
0
282
30
26
19
24
1.98
2956412--2956463
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
2964912--2964960
19
2.4
21
77
22
59
63
6
4
26
1.36
2965463--2965521
25
2.4
25
88
5
84
62
0
1
35
1.05
2965469--2965524
21
2.7
20
81
10
60
64
0
0
35
0.94
2969888--2969932
13
3.7
13
77
14
51
80
4
0
15
0.87
2970713--2970769
22
2.3
26
85
14
86
40
5
0
54
1.23
2970712--2970769
26
2.4
24
78
13
66
39
5
0
55
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770