Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  21  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5668610--5669108
46
10.8
46
92
1
669
21
24
14
39
1.91
5673623--5673677
27
2.0
27
100
0
110
10
23
0
65
1.24
5673668--5673724
30
1.9
30
85
0
78
1
26
1
70
1.07
5675048--5675089
22
1.9
22
95
0
75
19
16
16
47
1.83
5676685--5676786
46
2.2
46
82
6
134
24
18
27
29
1.98
5677280--5677310
11
2.8
11
100
0
62
25
0
19
54
1.44
5687877--5687910
3
11.3
3
93
0
59
32
0
29
38
1.58
5688007--5688052
21
2.2
21
84
7
58
28
2
43
26
1.66
5690536--5690568
14
2.3
15
90
10
52
9
9
6
75
1.18
5691397--5691630
125
1.9
125
81
3
283
29
16
16
37
1.91
5696996--5697462
232
2.0
232
98
0
907
33
16
15
34
1.90
5697391--5697514
64
1.9
64
90
0
194
31
16
15
36
1.90
5697745--5697841
45
2.2
46
85
7
128
31
18
22
26
1.97
5697622--5697883
133
2.0
133
82
3
321
31
19
20
29
1.97
5697720--5698595
177
4.9
176
88
1
1096
30
18
22
28
1.98
5697720--5698653
355
2.6
353
85
4
1193
30
18
22
27
1.97
5698605--5699076
84
5.6
84
83
4
531
34
21
24
19
1.96
5699332--5699399
30
2.3
29
82
7
84
32
48
1
17
1.56
5699830--5699862
14
2.4
14
90
10
50
9
9
9
72
1.28
5699989--5700027
21
1.9
20
84
5
51
30
5
7
56
1.49
5703846--5703883
19
2.0
19
94
0
67
34
10
23
31
1.89
5704152--5704193
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5704790--5704823
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
5705086--5705118
16
2.1
16
88
5
50
9
3
0
87
0.63
5706134--5706190
28
2.0
28
96
0
105
40
22
3
33
1.71
5715689--5715735
22
2.1
22
92
7
78
53
8
14
23
1.69
5724378--5724553
46
3.8
46
76
12
198
20
19
29
30
1.97
5724374--5724545
93
1.8
93
92
0
290
20
20
30
29
1.97
5727937--5727973
17
2.1
18
95
5
67
59
2
13
24
1.47
5730569--5730740
93
1.8
93
92
0
290
20
19
29
29
1.97
5730575--5730748
46
3.8
46
75
13
194
21
18
29
30
1.97
5742075--5742126
15
3.2
15
73
19
50
57
1
0
40
1.10
5742466--5742520
23
2.2
26
90
9
89
45
5
5
43
1.50
5744014--5744069
3
18.7
3
92
0
58
67
10
0
21
1.20
5746820--5746857
20
2.0
20
89
5
60
65
2
0
31
1.06
5748663--5748707
18
2.4
19
85
7
74
53
2
4
40
1.33
5754534--5754763
117
2.0
117
93
0
397
30
13
7
48
1.69
5767415--5767496
43
1.9
43
92
0
137
32
7
17
42
1.76
5769254--5769324
25
2.8
25
79
12
74
16
23
21
38
1.93
5770826--5770860
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
5777821--5777962
35
4.1
35
83
1
169
19
16
27
37
1.92
5777821--5777962
70
2.0
70
84
2
187
19
16
27
37
1.92
5778092--5778138
22
2.1
22
96
0
85
27
4
19
48
1.67
5783031--5783086
28
2.0
28
92
0
94
32
32
10
25
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5783074--5783207
40
3.3
40
82
0
151
34
23
15
26
1.95
5783959--5783995
10
3.5
11
82
17
51
0
16
0
83
0.64
5784033--5784067
3
11.7
3
100
0
70
34
34
0
31
1.58
5784200--5784228
11
2.5
12
88
11
51
6
6
0
86
0.72
5784494--5784564
23
3.3
22
71
11
58
54
0
8
36
1.31
5784494--5784575
42
2.0
42
82
4
103
50
1
7
41
1.38
5784385--5784695
143
2.2
144
86
7
424
43
4
8
44
1.53
5787827--5787963
47
2.9
47
94
0
238
34
11
16
37
1.85
5789243--5789425
48
3.8
48
83
5
217
20
18
26
35
1.95
5789249--5789425
96
1.8
96
85
0
246
19
18
26
35
1.95
5804636--5804801
35
4.6
37
81
10
173
31
10
24
32
1.90
5804636--5804806
75
2.4
75
84
7
212
32
11
23
32
1.90
5814493--5814635
55
2.6
56
79
2
155
26
23
28
21
1.99
5815309--5815347
18
2.2
18
95
0
69
23
7
5
64
1.40
5832012--5832047
19
1.9
19
88
5
56
58
22
8
11
1.59
5842486--5842554
24
2.8
25
76
8
72
14
27
23
34
1.94
5844123--5844180
29
2.0
30
86
10
84
39
3
20
36
1.70
5844595--5844678
43
2.0
43
85
4
116
22
16
32
28
1.96
5848075--5848245
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
5848067--5848242
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
5850610--5850697
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
5850610--5850688
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5850621--5850697
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
5853641--5853811
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98
5853633--5853808
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
5860855--5860938
43
2.0
43
83
4
107
23
15
33
27
1.95
5862739--5862786
2
24.0
2
100
0
96
50
0
0
50
1.00
5862899--5862939
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
5865535--5865615
39
2.1
39
97
0
153
35
7
29
27
1.84
5868594--5868665
30
2.4
30
81
4
74
22
20
31
25
1.98
5890970--5891049
26
3.0
26
75
12
83
33
1
6
58
1.31
5890940--5891049
53
2.1
53
86
6
152
33
3
5
57
1.39
5899639--5899678
20
2.0
20
100
0
80
25
10
10
55
1.64
5906134--5906188
27
2.0
27
100
0
110
43
0
21
34
1.53
5907667--5907883
92
2.5
84
77
12
240
43
14
23
18
1.87
5907706--5907876
46
3.7
46
89
0
234
44
15
22
17
1.86
5914439--5914508
10
7.3
10
75
15
58
67
2
1
28
1.14
5914424--5914511
9
9.3
9
74
8
68
62
3
2
31
1.24
5914947--5915005
9
6.6
9
75
19
52
32
6
0
61
1.22
5931646--5931708
28
2.3
26
86
7
90
23
14
6
55
1.62
5934507--5934723
90
2.4
89
82
6
262
40
19
7
32
1.79
5934824--5934895
19
3.7
20
82
10
87
65
1
4
29
1.20
5934816--5934896
29
2.9
29
77
14
80
64
1
3
30
1.19
5935144--5935180
18
2.1
18
89
0
56
45
0
0
54
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5950217--5950250
6
5.7
6
100
0
68
35
0
29
35
1.58
5954120--5954234
53
2.1
54
88
6
171
27
13
26
31
1.94
5961624--5961738
53
2.1
54
85
6
153
29
13
25
31
1.94
5963319--5963372
21
2.4
21
79
17
56
40
3
1
53
1.29
5963765--5963822
31
1.9
30
89
3
89
44
8
12
34
1.72
5964249--5964285
17
2.1
18
90
5
58
48
2
27
21
1.63
5964688--5964728
17
2.4
17
95
0
73
51
4
19
24
1.66
5976223--5976291
30
2.3
31
85
7
88
47
20
10
21
1.79
5976322--5976366
21
2.2
20
88
4
63
28
15
24
31
1.96
5980698--5980766
30
2.2
32
82
10
90
23
10
17
49
1.77
5985364--5985399
14
2.6
14
95
0
63
33
13
13
38
1.85
5992348--5992395
23
2.0
24
84
11
64
56
2
10
31
1.45
5992519--5992559
3
13.7
3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
5992548--5992603
15
3.7
15
77
17
53
53
1
16
28
1.53
5992521--5992619
18
5.3
18
77
9
67
57
2
11
29
1.44
5994782--5994824
21
2.0
21
100
0
86
39
23
4
32
1.75
6005581--6005619
20
2.0
20
85
10
53
43
0
10
46
1.37
6016474--6016498
12
2.1
12
100
0
50
44
24
8
24
1.80
6026811--6026842
12
2.7
12
100
0
64
53
0
15
31
1.43
6035949--6036051
29
3.6
29
87
0
143
25
33
15
26
1.95
6043419--6043487
24
2.8
24
72
18
63
1
39
1
57
1.16
6044449--6044495
24
1.9
25
87
12
71
17
6
2
74
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6046739--6046802
30
2.1
30
83
11
78
42
0
31
26
1.56
6054613--6054651
13
2.8
13
81
11
51
48
0
0
51
1.00
6060624--6061045
207
2.0
207
80
4
476
21
22
22
34
1.97
6060624--6061045
69
6.1
69
78
6
345
21
22
22
34
1.97
6060644--6061045
138
2.9
137
79
5
400
21
22
21
34
1.97
6069108--6069164
28
2.0
28
93
0
96
59
14
1
24
1.44
6072405--6072444
15
2.6
16
88
4
55
40
12
20
27
1.88
6075883--6075933
4
12.5
4
79
4
57
49
3
0
47
1.20
6075874--6075927
21
2.6
21
82
5
65
48
5
0
46
1.25
6077871--6077906
18
2.0
18
88
0
54
58
16
5
19
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770